More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0609 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  100 
 
 
468 aa  959    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  47.52 
 
 
484 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  35.31 
 
 
462 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  34.27 
 
 
480 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  34.13 
 
 
482 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.64 
 
 
462 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  36.09 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  34.28 
 
 
464 aa  253  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  32.75 
 
 
453 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  32.97 
 
 
453 aa  250  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  36.03 
 
 
470 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  32.75 
 
 
453 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  35.37 
 
 
464 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  35.29 
 
 
459 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  33.92 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  33.11 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  35.65 
 
 
452 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  33.33 
 
 
466 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.96 
 
 
454 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  32.89 
 
 
466 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  35.21 
 
 
455 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  32.93 
 
 
448 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  31.36 
 
 
461 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.07 
 
 
463 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  34.49 
 
 
470 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  30.72 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  31.92 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  31.3 
 
 
466 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  32.03 
 
 
470 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.01 
 
 
462 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  32.97 
 
 
463 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  32.82 
 
 
462 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  29.32 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  32.22 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  32.88 
 
 
463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  31.82 
 
 
466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  30.52 
 
 
458 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  29.71 
 
 
447 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  33.68 
 
 
1373 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.68 
 
 
1373 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  33.33 
 
 
452 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  31.27 
 
 
454 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  32.37 
 
 
444 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  33.42 
 
 
1373 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  33.42 
 
 
1380 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  33.42 
 
 
1373 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  33.42 
 
 
1373 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  33.42 
 
 
1373 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  33.42 
 
 
1373 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  33.5 
 
 
459 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  29.95 
 
 
462 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  30.75 
 
 
446 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  31.95 
 
 
451 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  31.01 
 
 
463 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  34.04 
 
 
1365 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  31.56 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.65 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.82 
 
 
489 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  32.09 
 
 
449 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.23 
 
 
447 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  31.68 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  35.41 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  31.01 
 
 
452 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.25 
 
 
446 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.11 
 
 
431 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.21 
 
 
458 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.41 
 
 
445 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  31.89 
 
 
457 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.98 
 
 
445 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  30.79 
 
 
460 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  28.28 
 
 
459 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  30.13 
 
 
449 aa  190  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  35.96 
 
 
474 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  30.91 
 
 
459 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  31.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  31.3 
 
 
445 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  30.3 
 
 
459 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  28.54 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.46 
 
 
432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  31.24 
 
 
457 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  31.35 
 
 
453 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  26.8 
 
 
525 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  29.34 
 
 
461 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  29.34 
 
 
495 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  31.38 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  29.23 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.61 
 
 
466 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  26.03 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.36 
 
 
471 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  29.44 
 
 
546 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  30.28 
 
 
473 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  28.51 
 
 
452 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  29.44 
 
 
450 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  30.89 
 
 
461 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  31.03 
 
 
453 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  30.19 
 
 
461 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.56 
 
 
452 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  29.36 
 
 
473 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  29.57 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.74 
 
 
479 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>