More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1432 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  100 
 
 
459 aa  897    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  98.47 
 
 
459 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  91.45 
 
 
452 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  58.85 
 
 
478 aa  494  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  56.39 
 
 
462 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  59.73 
 
 
462 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  56.76 
 
 
462 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  56.52 
 
 
461 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  54.87 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  45.08 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  43.57 
 
 
450 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  45.51 
 
 
455 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  39 
 
 
480 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  40.57 
 
 
462 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  39.46 
 
 
465 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  40.17 
 
 
470 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  38.68 
 
 
467 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  38.78 
 
 
464 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  39.25 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  39.04 
 
 
466 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  38.41 
 
 
463 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  38.53 
 
 
453 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  35.85 
 
 
462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  34.16 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  35.97 
 
 
466 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  34.49 
 
 
464 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  33.47 
 
 
470 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.54 
 
 
462 aa  229  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  32.27 
 
 
454 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  38.48 
 
 
463 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  34.93 
 
 
470 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.55 
 
 
484 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  33.78 
 
 
463 aa  210  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  31.95 
 
 
452 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  36.99 
 
 
473 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  30.94 
 
 
468 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  37.74 
 
 
471 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  36.51 
 
 
471 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.67 
 
 
482 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  36.55 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  34.16 
 
 
455 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  35.7 
 
 
466 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.42 
 
 
441 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  29.44 
 
 
448 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  34.97 
 
 
454 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  32.89 
 
 
458 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.8 
 
 
448 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.12 
 
 
1365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  33.41 
 
 
452 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 
1380 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  31.25 
 
 
1373 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  31.01 
 
 
1373 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  33.65 
 
 
437 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  31.01 
 
 
1373 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 
1373 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 
1373 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 
1373 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  36.01 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 
1373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  29.19 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.54 
 
 
453 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  30.46 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.75 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  30.61 
 
 
458 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.06 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.44 
 
 
460 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.81 
 
 
429 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  27.55 
 
 
457 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.87 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.44 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  32.4 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  32.25 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  30.86 
 
 
546 aa  173  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  29.78 
 
 
459 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.46 
 
 
446 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.55 
 
 
439 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.25 
 
 
432 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.7 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  32.68 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.95 
 
 
489 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  31.79 
 
 
449 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  29.61 
 
 
459 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  31.33 
 
 
453 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  30 
 
 
457 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  29.61 
 
 
444 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.95 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  29.22 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  32.8 
 
 
452 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.26 
 
 
445 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.91 
 
 
452 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.57 
 
 
430 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  29.51 
 
 
447 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  27.94 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  33.94 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  31.17 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  29.29 
 
 
433 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  28.12 
 
 
461 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  28.12 
 
 
495 aa  146  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  33.01 
 
 
473 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  27.34 
 
 
769 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>