More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3371 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  100 
 
 
478 aa  936    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  59.06 
 
 
459 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  55.95 
 
 
460 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  58.64 
 
 
459 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  55.8 
 
 
461 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  59.57 
 
 
452 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  54.5 
 
 
462 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  53.35 
 
 
462 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  53.81 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  48.37 
 
 
457 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  44.8 
 
 
450 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  47.8 
 
 
455 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  39.39 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  40.72 
 
 
453 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  40.43 
 
 
462 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  39.72 
 
 
465 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  39.59 
 
 
467 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  39.73 
 
 
470 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  39.1 
 
 
466 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  39.24 
 
 
466 aa  246  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  39.29 
 
 
464 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  35.32 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  36.94 
 
 
462 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  32.46 
 
 
454 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  33.18 
 
 
484 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  38.14 
 
 
463 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  36.32 
 
 
466 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  34.8 
 
 
470 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  36.84 
 
 
463 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  34.04 
 
 
470 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  34 
 
 
468 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  36.22 
 
 
464 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.76 
 
 
462 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.7 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  36.92 
 
 
437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  36.93 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  34.83 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  32.86 
 
 
459 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  33.56 
 
 
458 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  29.7 
 
 
448 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  37.88 
 
 
445 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  37.47 
 
 
463 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  38.58 
 
 
452 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  36.29 
 
 
454 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  34.4 
 
 
1380 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  38.67 
 
 
429 aa  203  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  34 
 
 
1373 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  34.42 
 
 
452 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  37.04 
 
 
452 aa  203  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  34.26 
 
 
1373 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  34 
 
 
1373 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  34 
 
 
1373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  34 
 
 
1373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  34 
 
 
1373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  34 
 
 
1373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  34.81 
 
 
452 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  32.97 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  33.19 
 
 
471 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  32.84 
 
 
455 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  35.87 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  33.25 
 
 
1365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.82 
 
 
453 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  33.5 
 
 
460 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.56 
 
 
441 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.57 
 
 
453 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  33.71 
 
 
458 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  37.59 
 
 
453 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.33 
 
 
453 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  31.77 
 
 
461 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28.17 
 
 
457 aa  189  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  32 
 
 
459 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  31.77 
 
 
495 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31.11 
 
 
448 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.54 
 
 
446 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  31.56 
 
 
451 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  33.76 
 
 
489 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  32.35 
 
 
457 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.63 
 
 
445 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  33.66 
 
 
473 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  32.68 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  34.81 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  30.42 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  30.88 
 
 
432 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  32.3 
 
 
439 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  32.84 
 
 
444 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  32.03 
 
 
460 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  35.04 
 
 
452 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  32.12 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  33.48 
 
 
469 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  35.66 
 
 
479 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.75 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  29.65 
 
 
452 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  31.86 
 
 
430 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  29.18 
 
 
459 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  30.41 
 
 
455 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  33.49 
 
 
444 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  32.33 
 
 
453 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  30.69 
 
 
454 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  30.79 
 
 
563 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  30.71 
 
 
447 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>