More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0777 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  100 
 
 		 466 aa  944    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  40.91 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  36.3 
 
 		 446 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  37.14 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  39.1 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  38.44 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  40.05 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  35.68 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  36.85 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  38.44 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  37.56 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  39.37 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  34.76 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  34.15 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  37.3 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  34.66 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  37.56 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  35.14 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.41 
 
 		 1373 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  33.18 
 
 		 1380 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  33.18 
 
 		 1373 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  33.41 
 
 		 1373 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  33.41 
 
 		 1373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  33.41 
 
 		 1373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  33.41 
 
 		 1373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  33.41 
 
 		 1373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.94 
 
 		 441 aa  243  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  34.74 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  33.18 
 
 		 1365 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  35.49 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  35.43 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  34.62 
 
 		 473 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  34.76 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  34.24 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  36.4 
 
 		 453 aa  229  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  33.18 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  33.41 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  31.24 
 
 		 459 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  31.04 
 
 		 447 aa  223  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.09 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  32.38 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  34.86 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  35.71 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  31.85 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  31.25 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  30.68 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  33.41 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  32.75 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  35.67 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.19 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  33.55 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  34.48 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  35.68 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  34.62 
 
 		 462 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  33.56 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  32.47 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  33.25 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  35.66 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  33.74 
 
 		 470 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  34.06 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  30.12 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  36.36 
 
 		 437 aa  203  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  31.26 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  32.7 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  29.66 
 
 		 455 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.92 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  34.64 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  32.38 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  31.4 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  31.54 
 
 		 462 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  31.41 
 
 		 471 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  32.52 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  34.96 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  30.84 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  31.07 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  30.3 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  30.94 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  32.44 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  29.47 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  31.14 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  29.18 
 
 		 460 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  29.96 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  31.94 
 
 		 456 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  30.88 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  35.32 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  33.25 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  31.13 
 
 		 455 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  30.88 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  35.32 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  30.02 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  31.28 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  31.34 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  29.69 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  34.99 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  28.77 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.93 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  29.2 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  29.2 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  30.91 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  28.82 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>