More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3012 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  100 
 
 
459 aa  942    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  36.01 
 
 
452 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  35.44 
 
 
482 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  32.01 
 
 
1373 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  32.23 
 
 
1380 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  32.01 
 
 
1373 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  32.02 
 
 
1373 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  32.02 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  32.02 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  32.02 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  32.02 
 
 
1373 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  32.24 
 
 
461 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  33.41 
 
 
444 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  32.67 
 
 
452 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  31.58 
 
 
454 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  31.1 
 
 
447 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  33.74 
 
 
452 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  30.18 
 
 
1365 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  31.35 
 
 
455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  34.01 
 
 
489 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  33.18 
 
 
460 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.08 
 
 
459 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  31.24 
 
 
466 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.72 
 
 
460 aa  223  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  31.66 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31.64 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.34 
 
 
441 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  30.52 
 
 
457 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  30.36 
 
 
448 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  31.94 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  32.14 
 
 
445 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  29.72 
 
 
454 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.98 
 
 
446 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.4 
 
 
445 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  31.5 
 
 
453 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.78 
 
 
447 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  32.13 
 
 
474 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  32.27 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  32.3 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  28.95 
 
 
469 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.47 
 
 
439 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  30.56 
 
 
432 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  29.16 
 
 
468 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  31.57 
 
 
470 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  28.19 
 
 
437 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  29.33 
 
 
461 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  30.91 
 
 
464 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  30.4 
 
 
433 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  29.51 
 
 
484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  31.14 
 
 
466 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  29.43 
 
 
431 aa  181  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  31.39 
 
 
467 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  28.99 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  31.14 
 
 
466 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.64 
 
 
463 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  28.5 
 
 
448 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  31.86 
 
 
463 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  28.64 
 
 
461 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  28.64 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.37 
 
 
458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  28.85 
 
 
473 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  30.58 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  31.21 
 
 
479 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  28.54 
 
 
453 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30.83 
 
 
471 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  30.94 
 
 
473 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  28.54 
 
 
474 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  28.54 
 
 
474 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  28.64 
 
 
457 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  27.61 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  27.29 
 
 
479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  28.12 
 
 
429 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  25.88 
 
 
462 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.27 
 
 
446 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  29.65 
 
 
457 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.64 
 
 
460 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  26.6 
 
 
470 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  30.53 
 
 
459 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  30.05 
 
 
459 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  27.32 
 
 
462 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  28.77 
 
 
465 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  27.32 
 
 
465 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  27.72 
 
 
461 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  26.59 
 
 
492 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27.31 
 
 
546 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  26.47 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  28.4 
 
 
1053 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  26.14 
 
 
492 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  28.73 
 
 
1064 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  26.65 
 
 
462 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  25.42 
 
 
452 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  27.81 
 
 
462 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0814  cytochrome P450  28.93 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  28.68 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  28 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  28.4 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  28.19 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  27.29 
 
 
1055 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  29.44 
 
 
478 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  29.63 
 
 
1079 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>