More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7149 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  100 
 
 		 456 aa  937    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  31.94 
 
 		 466 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  28.77 
 
 		 454 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.69 
 
 		 474 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  29.31 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.37 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.34 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.71 
 
 		 489 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  26.74 
 
 		 446 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.5 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  27.36 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.55 
 
 		 1373 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.44 
 
 		 1365 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.55 
 
 		 1373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.55 
 
 		 1373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.55 
 
 		 1373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.55 
 
 		 1373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.33 
 
 		 1373 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.33 
 
 		 1380 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.33 
 
 		 1373 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  26.94 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  28.43 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  28.73 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  28.47 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  27.47 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  29.24 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  28.35 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  26.85 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  28.3 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  26.25 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.23 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  28.81 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  27.52 
 
 		 462 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  29.03 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  26.54 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  27.23 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  28.31 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  27.27 
 
 		 462 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.36 
 
 		 459 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  26.7 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  29.37 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.45 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.57 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  25.27 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  29.26 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  29.02 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  29.57 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  25.51 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  26.56 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  25.12 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  25.33 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  28.28 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  28.54 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  26.41 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  42.16 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  25.66 
 
 		 452 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  27.27 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  27.34 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  29.52 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  26.04 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  26.06 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  29.29 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  28.36 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  33.48 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  24.43 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.73 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  26.65 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  26.67 
 
 		 429 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  28.68 
 
 		 430 aa  123  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  25.89 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  25.86 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.65 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  24.47 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  26.81 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  25.81 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  26.4 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  26.78 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  27.02 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  29.84 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  26.1 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  23.94 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  26.78 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.38 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  28.54 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  24.68 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  23.3 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  28.65 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  26.19 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.83 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  26.17 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  26.6 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  27.68 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.12 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  34.22 
 
 		 463 aa  112  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  25.67 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  25.67 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.08 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>