More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2711 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  100 
 
 
551 aa  1133    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  49.32 
 
 
451 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  47.79 
 
 
451 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  47.55 
 
 
451 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  47.55 
 
 
451 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  48.25 
 
 
452 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  46.19 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  44.54 
 
 
451 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  36.26 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  36.44 
 
 
471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08283  14-alpha sterol demethylase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96W77]  29.83 
 
 
526 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00402354  normal  0.130811 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63421  Cytochrome P450 51 (CYPLI) (P450-LIA1) (Sterol 14-alpha demethylase) (Lanosterol 14-alpha demethylase) (P450-14DM)  30.34 
 
 
526 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.195375  normal  0.579386 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00300  sterol 14-demethylase, putative  30.69 
 
 
550 aa  243  7.999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  29.78 
 
 
473 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01901  Cytochrome P450 sterol 14 alpha-demethylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P462]  29.11 
 
 
511 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  29.23 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  28.81 
 
 
448 aa  173  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  27.11 
 
 
459 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  30.54 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  26.59 
 
 
479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  27.55 
 
 
480 aa  161  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  29.29 
 
 
464 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  28.54 
 
 
469 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  28.92 
 
 
451 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  26.37 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  26.73 
 
 
459 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  27.44 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  26.42 
 
 
470 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  27.48 
 
 
468 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.2 
 
 
447 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  27 
 
 
453 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  25.6 
 
 
448 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.19 
 
 
473 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  27.48 
 
 
460 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  26.64 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  28.16 
 
 
497 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  24.82 
 
 
466 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  28.16 
 
 
497 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  27.58 
 
 
493 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  23 
 
 
454 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  26.42 
 
 
468 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  26.89 
 
 
440 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.54 
 
 
1373 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  25.54 
 
 
460 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.3 
 
 
1373 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  26.91 
 
 
493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.54 
 
 
1373 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  22.93 
 
 
457 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.54 
 
 
1373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.54 
 
 
1373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.54 
 
 
1373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.54 
 
 
1373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  24.26 
 
 
455 aa  137  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  24.76 
 
 
1380 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  22.68 
 
 
457 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  25.47 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  26.67 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  25.12 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  26.67 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  25 
 
 
1365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  26.67 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  25.48 
 
 
446 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  25.47 
 
 
480 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  24.82 
 
 
443 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  25.47 
 
 
480 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  25 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  25.57 
 
 
448 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.52 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  27.68 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  23.45 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  23.92 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  27.08 
 
 
445 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.01 
 
 
452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  24.76 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  28.66 
 
 
328 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  24.63 
 
 
433 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  23.38 
 
 
455 aa  130  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  24.43 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  23.13 
 
 
444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  22.38 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  29.08 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  26.4 
 
 
429 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.41 
 
 
441 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  26.4 
 
 
441 aa  127  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  23.21 
 
 
455 aa  126  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  24.69 
 
 
469 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  25.88 
 
 
1053 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  26.28 
 
 
482 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  25.73 
 
 
479 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  25.79 
 
 
448 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  25.35 
 
 
482 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  29.06 
 
 
440 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3498  cytochrome P450  26.76 
 
 
450 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.340562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  24.37 
 
 
430 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  24.57 
 
 
481 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  25.85 
 
 
451 aa  123  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  25.74 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.72 
 
 
453 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4834  cytochrome P450  26.17 
 
 
444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000050774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  23.99 
 
 
454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>