More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  100 
 
 
451 aa  900    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  53.36 
 
 
464 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  48.96 
 
 
449 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  51 
 
 
444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  45.45 
 
 
447 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  45.22 
 
 
447 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  45.22 
 
 
447 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  41.49 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  44.27 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  43.63 
 
 
448 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  42.66 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  39.87 
 
 
481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  41.53 
 
 
448 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  38.43 
 
 
460 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  35.03 
 
 
463 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  35.04 
 
 
453 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  37.56 
 
 
468 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  35.78 
 
 
454 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  37.77 
 
 
440 aa  249  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  33.96 
 
 
455 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  34.43 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  35.31 
 
 
455 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  33.9 
 
 
468 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  34.61 
 
 
455 aa  237  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  34.61 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  36.66 
 
 
476 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  34.82 
 
 
457 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  34.15 
 
 
455 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  34.82 
 
 
457 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  34.46 
 
 
445 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  34.69 
 
 
441 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  31.59 
 
 
467 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  35.35 
 
 
429 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  31.87 
 
 
473 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  31.87 
 
 
473 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  35.87 
 
 
454 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  33.26 
 
 
449 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  33.26 
 
 
449 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  34.76 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  33.03 
 
 
449 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  36.69 
 
 
490 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  33.01 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  32.72 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  35.7 
 
 
453 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  30.68 
 
 
447 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  30.53 
 
 
447 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  34.53 
 
 
440 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  32.18 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  35.73 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  33.68 
 
 
450 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  28.69 
 
 
444 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  33.59 
 
 
450 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  33.59 
 
 
450 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  30.59 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  33.25 
 
 
479 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.79 
 
 
460 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  32.01 
 
 
474 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.55 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.53 
 
 
454 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  28.7 
 
 
546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  29.52 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  34.53 
 
 
467 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.59 
 
 
447 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  34.73 
 
 
445 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  33.24 
 
 
442 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.08 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  30.55 
 
 
489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  28.35 
 
 
1373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  27.78 
 
 
459 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  29.48 
 
 
473 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  33.14 
 
 
484 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  28.35 
 
 
1373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  28.13 
 
 
1380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  28.35 
 
 
1373 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  28.35 
 
 
1373 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  28.13 
 
 
1373 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  28.35 
 
 
1373 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  28.35 
 
 
1373 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.85 
 
 
431 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.68 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.84 
 
 
446 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  30 
 
 
479 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  30.3 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  30.84 
 
 
470 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  32.92 
 
 
452 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  26.3 
 
 
470 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  26.41 
 
 
453 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  28.29 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  26.62 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  29.67 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  27.78 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  31.16 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  28.38 
 
 
1365 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  26.41 
 
 
453 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  31.17 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30.94 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.91 
 
 
441 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  31.4 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  32.37 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>