More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4677 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  100 
 
 		 480 aa  962    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  59.75 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  49.24 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  38.52 
 
 		 448 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  42.63 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  35.98 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  37.88 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  37.28 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  37.88 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  37.88 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  33.03 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  32.23 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  35.38 
 
 		 476 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  31.99 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  33.17 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  36.1 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  30.82 
 
 		 453 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  36.8 
 
 		 448 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  34.38 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  32.65 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  32.95 
 
 		 449 aa  213  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  31.01 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  35.31 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  35.31 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  35.05 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  31.87 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  32.35 
 
 		 455 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  31.87 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  30.47 
 
 		 468 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  31.26 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  36.34 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  30.73 
 
 		 455 aa  203  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  33.73 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  33.73 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  32.41 
 
 		 428 aa  203  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  33.72 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  34.66 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  31.12 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  35.73 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  33.24 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  34.94 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  33.03 
 
 		 450 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  34.18 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  34.18 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  32.21 
 
 		 454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  28.22 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  33.85 
 
 		 450 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  27.99 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  28.61 
 
 		 455 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  30.6 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  30.86 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  32.69 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  31.78 
 
 		 467 aa  163  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  25.81 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.74 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.15 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  29.31 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.59 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  29.05 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.53 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  27.32 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  30.88 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.87 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  27.07 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2260  cytochrome P450  29.72 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.859144  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.75 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.19 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30.38 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.32 
 
 		 1373 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.32 
 
 		 1373 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.32 
 
 		 1373 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.32 
 
 		 1373 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.06 
 
 		 1373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  29.91 
 
 		 464 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.38 
 
 		 1373 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.63 
 
 		 1380 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.41 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  30.45 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.13 
 
 		 1373 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  26.72 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.6 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  30.59 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  27.68 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  28.38 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  27.48 
 
 		 469 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  26.34 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  29.9 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.31 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.33 
 
 		 1365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  27.57 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  27.62 
 
 		 484 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  31.52 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  29.46 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  24.27 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  26.75 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  29.7 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  26.45 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  27.82 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  25 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>