More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3132 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  100 
 
 
444 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  51.17 
 
 
451 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  44.68 
 
 
464 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  39.26 
 
 
449 aa  280  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  40.71 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  41.53 
 
 
447 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  41.53 
 
 
447 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  41.53 
 
 
447 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  42.46 
 
 
472 aa  236  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  36.92 
 
 
448 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  35.96 
 
 
460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  38.14 
 
 
448 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  36.01 
 
 
476 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  36.47 
 
 
462 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  31.68 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  29.93 
 
 
455 aa  193  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  34.6 
 
 
481 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  36.39 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  30.94 
 
 
473 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  30.94 
 
 
473 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  31.97 
 
 
462 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  28.76 
 
 
453 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  32.94 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  33.04 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  32.93 
 
 
440 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  32.11 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  29.25 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  29.98 
 
 
457 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  32.35 
 
 
455 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  31 
 
 
454 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  29.74 
 
 
457 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  31.88 
 
 
449 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  31.88 
 
 
449 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  27.9 
 
 
468 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  30.84 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  30.84 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  33.64 
 
 
429 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  30.98 
 
 
445 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  31.79 
 
 
428 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  29.44 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  31.86 
 
 
441 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  30.08 
 
 
447 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  29.1 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  29.22 
 
 
457 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  29.95 
 
 
455 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  30.54 
 
 
450 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  32.23 
 
 
480 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  32.77 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  32.69 
 
 
440 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  33.25 
 
 
479 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.23 
 
 
439 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.16 
 
 
466 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  31.88 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.99 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  32.15 
 
 
1373 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  34.05 
 
 
484 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  31.9 
 
 
1373 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  31.47 
 
 
1373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.1 
 
 
459 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.65 
 
 
1380 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  33.07 
 
 
450 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  31.9 
 
 
1373 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  31.9 
 
 
1373 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  31.9 
 
 
1373 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  31.9 
 
 
1373 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  33.78 
 
 
450 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  33.78 
 
 
450 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.23 
 
 
445 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  24.5 
 
 
444 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.92 
 
 
444 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.64 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  28.88 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  31.29 
 
 
1365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.9 
 
 
452 aa  126  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  32.54 
 
 
489 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  28.74 
 
 
492 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  28.74 
 
 
492 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  33.33 
 
 
442 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  27.42 
 
 
447 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  32.5 
 
 
467 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  35.31 
 
 
416 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  30.25 
 
 
474 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  30.25 
 
 
474 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  28.98 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  28.65 
 
 
432 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  33.07 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  28.79 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  26.53 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  32.2 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  30.25 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  31.38 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.12 
 
 
430 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  29.27 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.58 
 
 
445 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  29.5 
 
 
508 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  29.97 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  25.69 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  30.16 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  29.1 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>