More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  100 
 
 
416 aa  814    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  51.76 
 
 
442 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  31.92 
 
 
453 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  31.94 
 
 
459 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  29.33 
 
 
457 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  29.1 
 
 
457 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  33.75 
 
 
468 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  34.66 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  32.42 
 
 
462 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  31.11 
 
 
457 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  29.35 
 
 
447 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  29.51 
 
 
455 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  29.35 
 
 
447 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  28.67 
 
 
468 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  28.99 
 
 
467 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  30.46 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  30.46 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  32.13 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  31.66 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  29 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  29 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  33.67 
 
 
455 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  33 
 
 
448 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  34.04 
 
 
450 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  30.83 
 
 
440 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  33.95 
 
 
450 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  33.95 
 
 
450 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  34.53 
 
 
464 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  32.8 
 
 
467 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  32.19 
 
 
481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  30.26 
 
 
459 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  32.09 
 
 
490 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  31.42 
 
 
449 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  31.81 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  31.81 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  32.3 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  25.13 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  33.71 
 
 
479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  31.55 
 
 
447 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  34.28 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  31.16 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  32.23 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  29.31 
 
 
480 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  28.93 
 
 
1380 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  28.77 
 
 
1373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  28.65 
 
 
1373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  30.91 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  30.28 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  28.65 
 
 
1373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  29.46 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  28.65 
 
 
1373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  28.65 
 
 
1373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  28.65 
 
 
1373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  28.65 
 
 
1373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  28.27 
 
 
476 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  30.84 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  27.3 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  26.32 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10028  cytochrome P450, putative (Eurofung)  30.38 
 
 
497 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.908419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  32.91 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  28.57 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  30.79 
 
 
453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  27.18 
 
 
428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  26.04 
 
 
492 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.12 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  30.38 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.96 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  34.42 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  28.91 
 
 
430 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.63 
 
 
454 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  27 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  35.93 
 
 
1365 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  27.3 
 
 
444 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.9 
 
 
460 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  30.66 
 
 
470 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  31.5 
 
 
470 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.98 
 
 
447 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  36.94 
 
 
464 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2260  cytochrome P450  27.22 
 
 
485 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.859144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.1 
 
 
463 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  27.48 
 
 
469 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.61 
 
 
452 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  26.36 
 
 
449 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  26.36 
 
 
449 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  25.26 
 
 
449 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  27.19 
 
 
470 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  36.08 
 
 
439 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  30.52 
 
 
489 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.12 
 
 
466 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.83 
 
 
471 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  29.78 
 
 
462 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  26.86 
 
 
484 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  30.61 
 
 
457 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  28.83 
 
 
471 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  28.03 
 
 
459 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.47 
 
 
432 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  30 
 
 
457 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  35.23 
 
 
466 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  34.52 
 
 
463 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  33.17 
 
 
495 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>