More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2260 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2260  cytochrome P450  100 
 
 
485 aa  1011    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.859144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  37.95 
 
 
492 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  37.44 
 
 
492 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  32.36 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  30.14 
 
 
444 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.48 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.67 
 
 
459 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.78 
 
 
454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  29.67 
 
 
479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  27.89 
 
 
466 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  28.78 
 
 
459 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  32.14 
 
 
452 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.3 
 
 
448 aa  151  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  28.65 
 
 
454 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  28.65 
 
 
454 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.63 
 
 
445 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  27.59 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  26.46 
 
 
453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  27.63 
 
 
445 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  26.04 
 
 
455 aa  143  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  29.29 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  28.16 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  27.23 
 
 
469 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  24.38 
 
 
463 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  27.79 
 
 
473 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.59 
 
 
1373 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  27.79 
 
 
473 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.59 
 
 
1373 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  27.84 
 
 
457 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.22 
 
 
489 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.59 
 
 
1373 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.81 
 
 
1380 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.59 
 
 
1373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.59 
 
 
1373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.59 
 
 
1373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.59 
 
 
1373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  26.51 
 
 
433 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.09 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.95 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.4 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.07 
 
 
460 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  28.61 
 
 
471 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  26.11 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  27.91 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  24.88 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  26.27 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  27.29 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  28.01 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  24.65 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.41 
 
 
445 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.28 
 
 
441 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  26.62 
 
 
470 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  27.27 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  26.74 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  27.9 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  30.03 
 
 
481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27.13 
 
 
546 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24.63 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.29 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0026  cytochrome P450-related protein  26.23 
 
 
468 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  28.45 
 
 
450 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0029  cytochrome P450 family protein  26.9 
 
 
468 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0023  cytochrome P450-related protein  26.9 
 
 
468 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0029  cytochrome P450-related protein  26.9 
 
 
468 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1176  cytochrome P450-related protein  26.9 
 
 
468 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1531  putative cytochrome monooxygenase related protein  26.9 
 
 
468 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  28.84 
 
 
466 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0043  cytochrome P450  26.09 
 
 
468 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  27.37 
 
 
479 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  29.08 
 
 
457 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  28.28 
 
 
466 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1456  cytochrome P450-related protein  27.68 
 
 
432 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  25.44 
 
 
1365 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  28.69 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  28.72 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  26.62 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  28.45 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  28.45 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  27.97 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.4 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  26.72 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  24.73 
 
 
482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  26.63 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  27.45 
 
 
440 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  25.95 
 
 
445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  30.29 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  25.75 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  26.87 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.17 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  25.5 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  27.64 
 
 
455 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  26.65 
 
 
467 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  27.64 
 
 
452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  25.96 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  23.95 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  26.61 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  25.36 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  27.6 
 
 
452 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  27.09 
 
 
452 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>