More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1413 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  100 
 
 
490 aa  973    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  59.75 
 
 
480 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  48.25 
 
 
481 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  44.59 
 
 
462 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  37.29 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  35.98 
 
 
468 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  39.39 
 
 
459 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  37.41 
 
 
447 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  37.41 
 
 
447 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  37.41 
 
 
447 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  29.6 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  32.17 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  32.17 
 
 
454 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  34.84 
 
 
448 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  31.52 
 
 
463 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  32.43 
 
 
455 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  32.85 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  30.68 
 
 
459 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  34.76 
 
 
464 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  33.11 
 
 
455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  30.61 
 
 
457 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  31.82 
 
 
468 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  36.59 
 
 
453 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  30.37 
 
 
457 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  31.74 
 
 
467 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  36.69 
 
 
451 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  35.77 
 
 
450 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  33.03 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  33.03 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  33.25 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  31.69 
 
 
473 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  31.69 
 
 
473 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  29.4 
 
 
447 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  29.4 
 
 
447 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  31.33 
 
 
445 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  36.04 
 
 
448 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  33.42 
 
 
476 aa  199  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  33.33 
 
 
441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  33.17 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  35.82 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  32.44 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  35.82 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  37.36 
 
 
472 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  34.35 
 
 
440 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  32.35 
 
 
428 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  30.77 
 
 
455 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  33 
 
 
440 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  32.2 
 
 
454 aa  183  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  30.49 
 
 
455 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  32.21 
 
 
450 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  28.19 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  31.43 
 
 
479 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  32.79 
 
 
429 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  33.71 
 
 
467 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.53 
 
 
444 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  32.53 
 
 
444 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.49 
 
 
448 aa  150  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  28.69 
 
 
446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  29.76 
 
 
492 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  30.95 
 
 
484 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  30.83 
 
 
441 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.8 
 
 
445 aa  143  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  30.46 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  29.17 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  31.49 
 
 
442 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  26.35 
 
 
459 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  32.09 
 
 
416 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.51 
 
 
454 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  28.3 
 
 
454 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.71 
 
 
439 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.64 
 
 
433 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.11 
 
 
466 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30.37 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.67 
 
 
1373 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24.72 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.67 
 
 
1373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.67 
 
 
1373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.67 
 
 
1373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.67 
 
 
1373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.67 
 
 
1373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.09 
 
 
445 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2260  cytochrome P450  27.9 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.859144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.42 
 
 
1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.67 
 
 
1380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  25.51 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.08 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30.14 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.68 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  26.49 
 
 
461 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  26.49 
 
 
495 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.71 
 
 
432 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  31.08 
 
 
461 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  26.88 
 
 
469 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  25.64 
 
 
452 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  32.86 
 
 
473 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.49 
 
 
1365 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  30.57 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  29.13 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  25.51 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  28.98 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>