More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3467 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  39.17 
 
 		 1075 aa  695    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  38.4 
 
 		 1065 aa  750    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  38.63 
 
 		 1065 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  38.53 
 
 		 1065 aa  756    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  38.81 
 
 		 1065 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  38.63 
 
 		 1065 aa  752    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  40.24 
 
 		 1059 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  40.17 
 
 		 1063 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  38.16 
 
 		 1065 aa  736    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  44.36 
 
 		 1055 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  38.63 
 
 		 1065 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  41.54 
 
 		 1072 aa  738    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  39.02 
 
 		 1006 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  41.79 
 
 		 1075 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  38.01 
 
 		 1071 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  100 
 
 		 1064 aa  2154    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  59.7 
 
 		 1079 aa  1193    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  43.03 
 
 		 1053 aa  827    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  38.53 
 
 		 1065 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  41.18 
 
 		 1074 aa  740    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  38.25 
 
 		 1065 aa  740    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  59.7 
 
 		 1079 aa  1193    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  35.68 
 
 		 1083 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  34.3 
 
 		 1096 aa  505  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  44.32 
 
 		 486 aa  347  8.999999999999999e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  39.29 
 
 		 521 aa  321  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  41.9 
 
 		 458 aa  266  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08004  cytochrome P450, putative (Eurofung)  33.72 
 
 		 469 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  28.75 
 
 		 561 aa  213  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  28.71 
 
 		 623 aa  210  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.76 
 
 		 607 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  30.4 
 
 		 1396 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.89 
 
 		 614 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  30.65 
 
 		 464 aa  197  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  30.65 
 
 		 1405 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  31.53 
 
 		 1257 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.6 
 
 		 613 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.06 
 
 		 591 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  29.01 
 
 		 608 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  28.3 
 
 		 613 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  31.13 
 
 		 588 aa  188  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.13 
 
 		 588 aa  188  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  29.76 
 
 		 599 aa  187  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.74 
 
 		 599 aa  187  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  29.76 
 
 		 599 aa  187  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  31.02 
 
 		 1418 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.98 
 
 		 607 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.02 
 
 		 1418 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.02 
 
 		 1398 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.81 
 
 		 596 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.54 
 
 		 602 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.02 
 
 		 1418 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.02 
 
 		 1418 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  31.02 
 
 		 1418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.02 
 
 		 1418 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.76 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  29.76 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  29.76 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.64 
 
 		 604 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.26 
 
 		 600 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  28.91 
 
 		 609 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  29.59 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  29.43 
 
 		 609 aa  186  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  29.59 
 
 		 599 aa  185  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  29.43 
 
 		 1400 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  30 
 
 		 601 aa  185  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.02 
 
 		 610 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.78 
 
 		 613 aa  184  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.01 
 
 		 607 aa  184  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  29.42 
 
 		 599 aa  184  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.64 
 
 		 447 aa  184  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  34.33 
 
 		 445 aa  184  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  29.59 
 
 		 599 aa  184  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 		 1403 aa  184  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  29.76 
 
 		 599 aa  183  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.06 
 
 		 1401 aa  183  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.64 
 
 		 604 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.64 
 
 		 604 aa  183  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.39 
 
 		 594 aa  183  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 		 1357 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.48 
 
 		 594 aa  182  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  29.51 
 
 		 599 aa  182  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  29.46 
 
 		 599 aa  181  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  24.18 
 
 		 675 aa  181  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  29.59 
 
 		 599 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  30.57 
 
 		 1427 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.05 
 
 		 599 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.42 
 
 		 599 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  32.3 
 
 		 453 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.11 
 
 		 598 aa  179  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  29.64 
 
 		 1384 aa  179  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.24 
 
 		 599 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 		 1409 aa  179  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.5 
 
 		 599 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.24 
 
 		 599 aa  179  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  31.55 
 
 		 401 aa  177  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  28.47 
 
 		 631 aa  177  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  26.25 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  32.02 
 
 		 474 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.03 
 
 		 629 aa  177  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>