More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4258 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  40.15 
 
 		 1075 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  40.41 
 
 		 1065 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  39.34 
 
 		 1071 aa  697    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  40.13 
 
 		 1065 aa  783    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  40.96 
 
 		 1065 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  40.69 
 
 		 1065 aa  794    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  41.58 
 
 		 1059 aa  758    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  40.35 
 
 		 1065 aa  783    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  42.06 
 
 		 1063 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  40.59 
 
 		 1065 aa  785    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  40.13 
 
 		 1065 aa  783    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  41.26 
 
 		 1006 aa  773    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  41.88 
 
 		 1072 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  42.8 
 
 		 1075 aa  775    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  59.7 
 
 		 1064 aa  1176    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  42.58 
 
 		 1053 aa  840    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  40.13 
 
 		 1065 aa  782    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  45.51 
 
 		 1055 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  42.13 
 
 		 1074 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  100 
 
 		 1079 aa  2173    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  40.59 
 
 		 1065 aa  795    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  100 
 
 		 1079 aa  2173    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  36.88 
 
 		 1083 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  36.02 
 
 		 1096 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  42.08 
 
 		 486 aa  334  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  41.74 
 
 		 521 aa  333  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  44.71 
 
 		 458 aa  285  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08004  cytochrome P450, putative (Eurofung)  32.2 
 
 		 469 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  32.94 
 
 		 464 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  34.28 
 
 		 447 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.39 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  29.07 
 
 		 561 aa  189  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  34.65 
 
 		 445 aa  184  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  34.2 
 
 		 446 aa  184  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.37 
 
 		 591 aa  183  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  30.1 
 
 		 1357 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  30.1 
 
 		 1257 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.51 
 
 		 598 aa  178  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  26.79 
 
 		 623 aa  178  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.35 
 
 		 607 aa  178  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00595  NADPH--cytochrome P450 reductase (Eurofung)  25.3 
 
 		 695 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.48 
 
 		 607 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.52 
 
 		 582 aa  175  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.58 
 
 		 448 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  27.3 
 
 		 1524 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  28.85 
 
 		 454 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  29.41 
 
 		 1341 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  30.84 
 
 		 1373 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.59 
 
 		 600 aa  172  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  30.84 
 
 		 1373 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.28 
 
 		 613 aa  171  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.84 
 
 		 1373 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 		 1338 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.76 
 
 		 594 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.57 
 
 		 610 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.27 
 
 		 588 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  27.35 
 
 		 613 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.41 
 
 		 599 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.27 
 
 		 588 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  30.19 
 
 		 1380 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.69 
 
 		 599 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.21 
 
 		 596 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.11 
 
 		 599 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.66 
 
 		 604 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  28.38 
 
 		 608 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  34.72 
 
 		 470 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.94 
 
 		 599 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 		 1409 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.49 
 
 		 604 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.61 
 
 		 599 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.61 
 
 		 599 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.16 
 
 		 614 aa  164  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  33.52 
 
 		 454 aa  164  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.52 
 
 		 604 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  29.8 
 
 		 628 aa  164  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  32.73 
 
 		 459 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  33.1 
 
 		 463 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  27.96 
 
 		 600 aa  163  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 		 1403 aa  164  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.66 
 
 		 613 aa  162  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.62 
 
 		 595 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 		 1407 aa  160  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  32.9 
 
 		 462 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  27.43 
 
 		 1401 aa  160  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.56 
 
 		 466 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  30.32 
 
 		 615 aa  160  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  30.33 
 
 		 1365 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 		 1384 aa  158  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.12 
 
 		 441 aa  157  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.79 
 
 		 608 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.03 
 
 		 595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.1 
 
 		 439 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  27.04 
 
 		 612 aa  155  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.28 
 
 		 589 aa  155  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.03 
 
 		 595 aa  155  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  23.81 
 
 		 675 aa  155  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>