More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5109 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  43.62 
 
 
1055 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  37.86 
 
 
1083 aa  651    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  47.7 
 
 
1074 aa  916    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  44.92 
 
 
1006 aa  875    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.83 
 
 
1065 aa  899    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.64 
 
 
1065 aa  900    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  43.78 
 
 
1065 aa  905    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  43.31 
 
 
1065 aa  897    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  41.31 
 
 
1063 aa  785    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.78 
 
 
1065 aa  897    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.64 
 
 
1065 aa  900    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  43.31 
 
 
1065 aa  892    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  44.99 
 
 
1072 aa  865    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.78 
 
 
1065 aa  900    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  45.7 
 
 
1075 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  37.99 
 
 
1064 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  42.16 
 
 
1059 aa  785    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  65.96 
 
 
1075 aa  1424    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.69 
 
 
1065 aa  897    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  100 
 
 
1071 aa  2172    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  42.15 
 
 
1053 aa  831    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  39.19 
 
 
1079 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  39.19 
 
 
1079 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  38.68 
 
 
1096 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  39.96 
 
 
521 aa  335  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  38.7 
 
 
486 aa  314  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  32.98 
 
 
561 aa  262  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  34.05 
 
 
464 aa  257  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  39.95 
 
 
458 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  31.21 
 
 
623 aa  252  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00595  NADPH--cytochrome P450 reductase (Eurofung)  29.19 
 
 
695 aa  248  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.27 
 
 
607 aa  235  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  28.44 
 
 
675 aa  228  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.42 
 
 
599 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.04 
 
 
613 aa  218  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  30.64 
 
 
1524 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.85 
 
 
594 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.42 
 
 
599 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.42 
 
 
599 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.42 
 
 
599 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.25 
 
 
599 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  35.05 
 
 
401 aa  211  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.78 
 
 
604 aa  211  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  30.86 
 
 
1257 aa  211  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.79 
 
 
607 aa  210  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.33 
 
 
604 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.68 
 
 
596 aa  209  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.82 
 
 
600 aa  208  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.26 
 
 
610 aa  207  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.8 
 
 
598 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.23 
 
 
604 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  32.65 
 
 
883 aa  205  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.19 
 
 
614 aa  204  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  31.11 
 
 
1313 aa  202  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.78 
 
 
613 aa  201  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  32.12 
 
 
1341 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.22 
 
 
600 aa  201  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.66 
 
 
591 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  32.6 
 
 
1342 aa  200  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  34.13 
 
 
1312 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 
1357 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.15 
 
 
599 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.96 
 
 
608 aa  197  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.38 
 
 
614 aa  197  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  32.18 
 
 
1396 aa  197  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 
1317 aa  197  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  29.38 
 
 
613 aa  197  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.66 
 
 
594 aa  197  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  29.29 
 
 
1407 aa  197  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
388 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 
1338 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  32.12 
 
 
1384 aa  193  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01320  electron transporter, putative  27.61 
 
 
741 aa  192  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.02 
 
 
610 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  29.71 
 
 
623 aa  193  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  29.08 
 
 
608 aa  192  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.25 
 
 
584 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40283  predicted protein  28.21 
 
 
633 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  30.09 
 
 
602 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  28.65 
 
 
563 aa  189  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.81 
 
 
1405 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  30.31 
 
 
631 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  31.43 
 
 
628 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
1409 aa  184  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.31 
 
 
1232 aa  182  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.89 
 
 
626 aa  182  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.89 
 
 
629 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  30.89 
 
 
599 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
538 aa  180  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  30.72 
 
 
446 aa  177  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  30.51 
 
 
599 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  30.32 
 
 
599 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  27.57 
 
 
595 aa  176  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  30.7 
 
 
599 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  30.51 
 
 
599 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.64 
 
 
1427 aa  175  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  30.39 
 
 
599 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  30.39 
 
 
599 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  30.39 
 
 
599 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  30.39 
 
 
599 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>