More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2227 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  100 
 
 
446 aa  895    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  31.17 
 
 
464 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  31.92 
 
 
1053 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  34.87 
 
 
1079 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  34.87 
 
 
1079 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  32.17 
 
 
1072 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  36.04 
 
 
458 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  31.52 
 
 
1075 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  31.63 
 
 
1055 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  33.85 
 
 
1075 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  29.89 
 
 
1065 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  31.02 
 
 
1071 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  31.17 
 
 
486 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.89 
 
 
1065 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.45 
 
 
1065 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.45 
 
 
1065 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.89 
 
 
1065 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  30.11 
 
 
1065 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.33 
 
 
1065 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  29.96 
 
 
1065 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.74 
 
 
1065 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  30.17 
 
 
1074 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  32.01 
 
 
1064 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  27.88 
 
 
1063 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  27.19 
 
 
1059 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.56 
 
 
1006 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  30.59 
 
 
441 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  31.39 
 
 
1096 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  33.26 
 
 
447 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.07 
 
 
454 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.33 
 
 
445 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  33.52 
 
 
474 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  33.52 
 
 
474 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  33.52 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  27.67 
 
 
1083 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.64 
 
 
463 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.77 
 
 
453 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.91 
 
 
459 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.85 
 
 
466 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  32.24 
 
 
459 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.16 
 
 
452 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  27.62 
 
 
484 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.16 
 
 
446 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  34.16 
 
 
457 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.58 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  30.79 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  32.24 
 
 
458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  44.51 
 
 
453 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  27.38 
 
 
451 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  25.94 
 
 
448 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  32.08 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.04 
 
 
482 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.47 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  34.04 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  26.3 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  38.11 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.92 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  30.53 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  30.5 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  25.92 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  26.19 
 
 
644 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  30.18 
 
 
452 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  32.2 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  29.22 
 
 
463 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  30.43 
 
 
466 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  30 
 
 
461 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.33 
 
 
439 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  27.44 
 
 
446 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  27.74 
 
 
461 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.42 
 
 
460 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  32.89 
 
 
465 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  31.19 
 
 
462 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  38.12 
 
 
465 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  34.68 
 
 
489 aa  124  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  24.74 
 
 
448 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  30.56 
 
 
452 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  29.9 
 
 
1380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.14 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  33.23 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27.82 
 
 
546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  31.85 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.31 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  33.24 
 
 
470 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08004  cytochrome P450, putative (Eurofung)  26.06 
 
 
469 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  29.95 
 
 
1365 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  31.14 
 
 
460 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  39.09 
 
 
429 aa  120  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  28.76 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  29.12 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  29.12 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  28.48 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  28.76 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  28.76 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  28.76 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  31.59 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  28.76 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  33.6 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.53 
 
 
462 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  28.33 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  32.02 
 
 
480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>