More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3382 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  100 
 
 
487 aa  962    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  44.78 
 
 
599 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6014  cytochrome P450  43.39 
 
 
476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0711  cytochrome P450  39.31 
 
 
459 aa  322  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3634  cytochrome P450  37.42 
 
 
462 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  29.26 
 
 
1075 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  33.56 
 
 
446 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.11 
 
 
446 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  27.04 
 
 
448 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  29.25 
 
 
1055 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  28.06 
 
 
1053 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  28.83 
 
 
1071 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  29.18 
 
 
473 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.18 
 
 
466 aa  153  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  28.84 
 
 
445 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  24.95 
 
 
1065 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  28.23 
 
 
454 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.41 
 
 
1083 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  28.6 
 
 
469 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  25.1 
 
 
1065 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  25.1 
 
 
1065 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.74 
 
 
1065 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.74 
 
 
1065 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.05 
 
 
1065 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.74 
 
 
1065 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.7 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.21 
 
 
1065 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.98 
 
 
454 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  28.06 
 
 
441 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.79 
 
 
1065 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  28.77 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  27.96 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  29.31 
 
 
1096 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.61 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  29.89 
 
 
463 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.78 
 
 
433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  27.88 
 
 
447 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  23.29 
 
 
563 aa  133  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  28.57 
 
 
455 aa  133  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  30.25 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  25.8 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  28.31 
 
 
457 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30.18 
 
 
462 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  25 
 
 
1063 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  31.16 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.23 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  26.28 
 
 
1059 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  26.16 
 
 
1074 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.67 
 
 
432 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  25.53 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  26.07 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  27.8 
 
 
1064 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.81 
 
 
452 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  25.53 
 
 
492 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  32.62 
 
 
465 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  28.8 
 
 
525 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  27.34 
 
 
444 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30.11 
 
 
459 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.88 
 
 
1365 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.22 
 
 
1373 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.79 
 
 
1373 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.79 
 
 
1373 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.79 
 
 
1373 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.79 
 
 
1373 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.79 
 
 
1373 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  27.27 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25 
 
 
1006 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.22 
 
 
1373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  26.5 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.22 
 
 
1380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  29.36 
 
 
484 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  28.71 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  24.19 
 
 
459 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  22.99 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  22.72 
 
 
453 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  22.92 
 
 
461 aa  119  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  29.4 
 
 
1079 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  28.54 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  29.4 
 
 
1079 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  24.77 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  28.28 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.29 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  28.72 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  25.74 
 
 
1075 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  24.6 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  27.82 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  25.32 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  23.72 
 
 
459 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  24.6 
 
 
454 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  27.99 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35590  n-alkane inducible cytochrome P- 450  25.81 
 
 
523 aa  116  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  27.92 
 
 
479 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  28.07 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  28.8 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  29.95 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  24.85 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  25.76 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  23.21 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  29.51 
 
 
467 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  22.08 
 
 
560 aa  114  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>