More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3395 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.09 
 
 
725 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  51.84 
 
 
726 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  63.18 
 
 
728 aa  841    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  73.02 
 
 
730 aa  982    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.99 
 
 
739 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.99 
 
 
739 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
732 aa  1422    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  49.01 
 
 
756 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  48.65 
 
 
736 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  48.98 
 
 
732 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  47.37 
 
 
734 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.38 
 
 
736 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  47.7 
 
 
779 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  47.7 
 
 
779 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.72 
 
 
735 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  47.14 
 
 
782 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.43 
 
 
740 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.48 
 
 
725 aa  548  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.07 
 
 
725 aa  545  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  47.95 
 
 
653 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  47.95 
 
 
653 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.59 
 
 
718 aa  270  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.25 
 
 
727 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.46 
 
 
732 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  37.21 
 
 
800 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  29.81 
 
 
783 aa  174  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.79 
 
 
842 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  28.15 
 
 
844 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  27.59 
 
 
850 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  27.61 
 
 
850 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.66 
 
 
851 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.34 
 
 
461 aa  131  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.86 
 
 
844 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.31 
 
 
730 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.42 
 
 
849 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.91 
 
 
526 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.42 
 
 
850 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.17 
 
 
850 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.64 
 
 
511 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
466 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.63 
 
 
735 aa  115  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  36.56 
 
 
1342 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.76 
 
 
509 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.49 
 
 
534 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.35 
 
 
1232 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  32.74 
 
 
609 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  39.8 
 
 
1075 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
609 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  33.92 
 
 
1384 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.72 
 
 
626 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.72 
 
 
629 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  33.33 
 
 
623 aa  101  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.61 
 
 
607 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  33.05 
 
 
376 aa  101  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.46 
 
 
594 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.41 
 
 
613 aa  100  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
599 aa  100  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  32.74 
 
 
599 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.19 
 
 
614 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.31 
 
 
840 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.95 
 
 
604 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  32.3 
 
 
599 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.7 
 
 
614 aa  99.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  36.11 
 
 
883 aa  99.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
599 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  32.3 
 
 
599 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.95 
 
 
604 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.49 
 
 
604 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
599 aa  99  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.56 
 
 
594 aa  99  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  35.81 
 
 
1418 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.56 
 
 
600 aa  99  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 
1418 aa  98.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 
1418 aa  98.6  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  35.81 
 
 
1398 aa  98.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  35.81 
 
 
1418 aa  98.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  38.64 
 
 
1072 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.42 
 
 
600 aa  98.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 
1418 aa  98.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 
1418 aa  98.6  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  31.42 
 
 
601 aa  98.2  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.86 
 
 
599 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  31.86 
 
 
599 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
599 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  31.86 
 
 
599 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.3 
 
 
599 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  35.35 
 
 
1427 aa  97.8  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.56 
 
 
596 aa  97.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.75 
 
 
607 aa  97.4  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  36.7 
 
 
659 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  32.3 
 
 
599 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  39.15 
 
 
1055 aa  97.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  32.6 
 
 
599 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  32.6 
 
 
599 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.77 
 
 
612 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  31.42 
 
 
599 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  34.65 
 
 
628 aa  97.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  32.41 
 
 
602 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.07 
 
 
1383 aa  96.3  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.86 
 
 
599 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>