More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5389 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  61.75 
 
 		 779 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  73.64 
 
 		 736 aa  1077    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  61.75 
 
 		 779 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  62.94 
 
 		 653 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  64.43 
 
 		 756 aa  928    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 		 732 aa  1473    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.23 
 
 		 739 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.23 
 
 		 739 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  61.51 
 
 		 782 aa  908    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  62.94 
 
 		 653 aa  779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.81 
 
 		 736 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.57 
 
 		 726 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.72 
 
 		 740 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  45.16 
 
 		 734 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.41 
 
 		 730 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.93 
 
 		 735 aa  588  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.98 
 
 		 732 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.54 
 
 		 728 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.36 
 
 		 725 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.23 
 
 		 725 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.82 
 
 		 725 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.89 
 
 		 732 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.85 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.59 
 
 		 718 aa  254  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  34.16 
 
 		 800 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  29.35 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.8 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.22 
 
 		 850 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.14 
 
 		 851 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.99 
 
 		 842 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.91 
 
 		 850 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.43 
 
 		 849 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.64 
 
 		 843 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25 
 
 		 840 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.38 
 
 		 850 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  25.9 
 
 		 850 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.88 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  31.72 
 
 		 466 aa  138  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.74 
 
 		 844 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  27.29 
 
 		 844 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.1 
 
 		 735 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.48 
 
 		 730 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  25.28 
 
 		 822 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  29.41 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.39 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  35.53 
 
 		 1342 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  39.17 
 
 		 1232 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  34.45 
 
 		 628 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  37.45 
 
 		 1065 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  37.45 
 
 		 1065 aa  111  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  37.45 
 
 		 1065 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  37.02 
 
 		 1065 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  37.02 
 
 		 1065 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  37.02 
 
 		 1065 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.73 
 
 		 521 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  37.45 
 
 		 1065 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  35.81 
 
 		 1418 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 		 1418 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 		 1418 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  35.81 
 
 		 1398 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  35.35 
 
 		 1427 aa  108  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 		 1418 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  35.81 
 
 		 1418 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 		 1418 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 659 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.41 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  35.74 
 
 		 1065 aa  107  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  34.88 
 
 		 539 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  36.17 
 
 		 1006 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  35.74 
 
 		 1065 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  34.36 
 
 		 1400 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0719  oxidoreductase, FAD-binding  35.19 
 
 		 350 aa  105  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  37.91 
 
 		 1055 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.76 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  37.02 
 
 		 1075 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  32.96 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.16 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  37.84 
 
 		 1075 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.68 
 
 		 1384 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0752  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.18 
 
 		 612 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.81 
 
 		 1401 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  36.28 
 
 		 883 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  34.33 
 
 		 376 aa  102  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  35.65 
 
 		 1396 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  33.95 
 
 		 1405 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0675  hypothetical protein  49.49 
 
 		 124 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00717845  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0563  sulfite reductase, alpha subunit  49.49 
 
 		 124 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.525967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.49 
 
 		 607 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0839  NADPH-sulfite reductase flavoprotein subunit  32.71 
 
 		 612 aa  100  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.305761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  35.35 
 
 		 1403 aa  100  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  32.41 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  38 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  33.91 
 
 		 1071 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  36.26 
 
 		 1409 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  37.22 
 
 		 1312 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  32.98 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  34.26 
 
 		 539 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  36.61 
 
 		 1072 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.46 
 
 		 584 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.96 
 
 		 596 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>