146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1624 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 464 aa  906    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  906    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  97.41 
 
 		 464 aa  864    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  58.04 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  50.81 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  50.32 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  48.66 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  48.73 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  48.42 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  49.01 
 
 		 486 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  44.99 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  48.58 
 
 		 488 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  42.98 
 
 		 472 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.59 
 
 		 560 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  45.04 
 
 		 493 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.62 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  48.74 
 
 		 486 aa  322  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.11 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  41.32 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  41.89 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  39.57 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  39.78 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  34.79 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  32.91 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  29.35 
 
 		 455 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  28.88 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  28.67 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  29.68 
 
 		 489 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  28.7 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  29.85 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.37 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  28.71 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  28.85 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.27 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  27.59 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  28.01 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  27.8 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  28.73 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  28.76 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  28.63 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  26.85 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  28 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  29.24 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  23.43 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  23.43 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  28.38 
 
 		 470 aa  113  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.4 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  25.15 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  25.12 
 
 		 511 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.85 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  23.88 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  28.79 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  23.21 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  23.88 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  34.5 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  23.44 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  23.44 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.11 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  22.99 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  34.11 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  23.21 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  23.21 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  23.54 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.89 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  27.35 
 
 		 518 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  27.08 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  26.99 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  27.34 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  24.4 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  26.49 
 
 		 461 aa  87  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.93 
 
 		 849 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.68 
 
 		 850 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.08 
 
 		 850 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.19 
 
 		 851 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  22.37 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.45 
 
 		 840 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.84 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  24.46 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.42 
 
 		 842 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.43 
 
 		 844 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  26.49 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.01 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.11 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  30.77 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  30.18 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.26 
 
 		 843 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.14 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.12 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  20.36 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  23.4 
 
 		 822 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.73 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.05 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  18.36 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.56 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  22.22 
 
 		 850 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  22.75 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.67 
 
 		 732 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.16 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.69 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>