169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0237 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  863    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  26.88 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.84 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  28.5 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25.83 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.08 
 
 		 371 aa  97.8  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  27.76 
 
 		 850 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  28.22 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  25.49 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  26.26 
 
 		 850 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  25 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  29.59 
 
 		 783 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  25.4 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.07 
 
 		 459 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.95 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  26.28 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  24.76 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.71 
 
 		 842 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.78 
 
 		 843 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.64 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  25.34 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.75 
 
 		 840 aa  87  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  26.9 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.48 
 
 		 405 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  29.6 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.3 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  25.1 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  30.77 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  25.29 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  26.02 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  25.84 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.31 
 
 		 850 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  26.83 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.98 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.94 
 
 		 850 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  27.17 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  27.57 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  25.06 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  22.28 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  26.38 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.18 
 
 		 851 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  27.31 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  28.8 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1117 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  28.74 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  25.94 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.43 
 
 		 849 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  25.96 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  28.31 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  27.1 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.29 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  25.76 
 
 		 844 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  22.88 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.3 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  23.54 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  25.84 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  26.85 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  27.6 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.06 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.62 
 
 		 844 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  26.42 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  26.42 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 		 885 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  24.49 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  21.7 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.61 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  26.07 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  21.01 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.64 
 
 		 822 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.52 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  26.28 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  27.94 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.58 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.42 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  29.84 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  30.17 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  22.05 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  25.46 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.75 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.82 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  25.52 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.53 
 
 		 849 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  27.54 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  21.28 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  28.53 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.64 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.27 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  24.39 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  25.23 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.46 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  30.42 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 		 840 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.64 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  23.51 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  25.63 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  26 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>