178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0872 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  100 
 
 		 348 aa  702    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  49.57 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  44.57 
 
 		 366 aa  332  5e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  34.45 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  29.86 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  34.18 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  26.99 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.69 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  22.97 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  21.25 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.13 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.26 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.53 
 
 		 389 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.26 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.83 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.55 
 
 		 389 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.98 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.74 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.34 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  21.33 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.52 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  21.35 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.49 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  19.74 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  22.34 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  22.55 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  21.43 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  18.03 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  22.16 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.64 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  21.8 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  21.25 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  20.91 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  21.77 
 
 		 850 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  22.04 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  20.21 
 
 		 783 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  20.64 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  21.02 
 
 		 850 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  22.91 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  20.92 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  20.83 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.83 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  23.02 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  21.51 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  25.22 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  19.37 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  19.14 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.12 
 
 		 503 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  20.1 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  22.04 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.59 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  22.96 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  19.36 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  21.39 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  22.57 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.83 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  19.24 
 
 		 842 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  21.63 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  19.12 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  21.24 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.62 
 
 		 734 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  19.79 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  19.9 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  18.44 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  21.74 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  19.95 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  23.26 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  20.27 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  19.41 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  19.41 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.9 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  18.75 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  18.45 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.47 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  18.45 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  18.45 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  19.95 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  24.32 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.52 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  21.27 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  22.13 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  20.27 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  22.93 
 
 		 455 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  18.44 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  20.86 
 
 		 840 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  19.26 
 
 		 851 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.05 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.15 
 
 		 559 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22 
 
 		 732 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  20.38 
 
 		 459 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  20.48 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  21.28 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  19.18 
 
 		 455 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  23.9 
 
 		 457 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  21.09 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.78 
 
 		 530 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.16 
 
 		 740 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  18.09 
 
 		 844 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.04 
 
 		 408 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>