182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4625 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  65.69 
 
 		 489 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  67.84 
 
 		 487 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  82.87 
 
 		 504 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  66.08 
 
 		 491 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 		 512 aa  1033    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  37.17 
 
 		 457 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  37.01 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  36.59 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  38.32 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  38.72 
 
 		 471 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  35.64 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  35.93 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  35.71 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  35.23 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  35.92 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.86 
 
 		 456 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  35.48 
 
 		 461 aa  289  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  33.61 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  37.76 
 
 		 456 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  33.88 
 
 		 472 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  34.76 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.01 
 
 		 457 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  32.85 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  33.4 
 
 		 470 aa  233  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  34.12 
 
 		 470 aa  233  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  32.93 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  32.56 
 
 		 530 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  33.68 
 
 		 470 aa  229  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  31.55 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  36.64 
 
 		 518 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  32.34 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  31.26 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.7 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  29.62 
 
 		 450 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  28.11 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  32.03 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  30.27 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  26.75 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  26.75 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  26.65 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  26.65 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  26.24 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  26.75 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  28.92 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  26.35 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  25.85 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  25.85 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  23.86 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  23.86 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  28.46 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.02 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.42 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  28.18 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 459 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  29.27 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.27 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  30.22 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  28.37 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  27.6 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  27.52 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.7 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  27.57 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  29.78 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  28.86 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.73 
 
 		 493 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  27.98 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.93 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  25.06 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.87 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  34.62 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  34.5 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  29.88 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  34.15 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  33.18 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  27.65 
 
 		 411 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.1 
 
 		 385 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.98 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  26.87 
 
 		 388 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  30.25 
 
 		 783 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.95 
 
 		 844 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  30.18 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  32.66 
 
 		 488 aa  87.8  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.24 
 
 		 842 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 403 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.7 
 
 		 849 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.7 
 
 		 851 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.7 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  32.08 
 
 		 850 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.09 
 
 		 840 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.23 
 
 		 850 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  25.82 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  31.67 
 
 		 850 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.69 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>