136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4207 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  100 
 
 
490 aa  969    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  68.74 
 
 
474 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  48.2 
 
 
464 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.2 
 
 
464 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.36 
 
 
464 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  47.98 
 
 
479 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  45.2 
 
 
469 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  48.54 
 
 
489 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  43.09 
 
 
483 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  49.09 
 
 
488 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.84 
 
 
560 aa  329  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.12 
 
 
493 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  42.24 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  43.65 
 
 
486 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.01 
 
 
486 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  39.87 
 
 
484 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  38.61 
 
 
507 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  42.12 
 
 
507 aa  280  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  39.64 
 
 
472 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.15 
 
 
464 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.52 
 
 
455 aa  266  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  40.22 
 
 
495 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  33.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  30.24 
 
 
455 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  29.76 
 
 
455 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  30.55 
 
 
455 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  31.45 
 
 
461 aa  154  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  30.75 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  28.67 
 
 
454 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  26.86 
 
 
459 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  30.64 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.19 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.78 
 
 
512 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  29.35 
 
 
471 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  29.14 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  29.2 
 
 
457 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  27 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  28.78 
 
 
484 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  26.98 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  27.78 
 
 
472 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  27.58 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  27.36 
 
 
450 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  25.54 
 
 
446 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  25.54 
 
 
446 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  28.85 
 
 
470 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  29.27 
 
 
461 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  33.33 
 
 
487 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  35.17 
 
 
491 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  25.17 
 
 
433 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  25.17 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  25.22 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  24.89 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  34.71 
 
 
489 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  24.06 
 
 
433 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  25.17 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.46 
 
 
840 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  30.19 
 
 
456 aa  97.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  25.17 
 
 
433 aa  97.4  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  26.52 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  24.94 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  24.94 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  24.94 
 
 
511 aa  94  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.89 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  25.98 
 
 
489 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.63 
 
 
457 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.66 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  28.92 
 
 
460 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  26.63 
 
 
850 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.14 
 
 
850 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.86 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.8 
 
 
849 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  27.14 
 
 
479 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.39 
 
 
850 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.55 
 
 
850 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  33.89 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.91 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.56 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.7 
 
 
822 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.67 
 
 
851 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.57 
 
 
842 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  34.75 
 
 
518 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  26.08 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  27.14 
 
 
844 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  30.63 
 
 
362 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.96 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.18 
 
 
843 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  25.56 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.81 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  24.4 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.27 
 
 
369 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25.21 
 
 
394 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  23.51 
 
 
783 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.17 
 
 
405 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  31.02 
 
 
782 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  30.26 
 
 
426 aa  58.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.71 
 
 
844 aa  57.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.3 
 
 
409 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  26.7 
 
 
381 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  30.09 
 
 
779 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>