137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3353 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 
493 aa  986    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  56.64 
 
 
560 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  45.36 
 
 
469 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  46.55 
 
 
464 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.55 
 
 
464 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.55 
 
 
464 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  45.91 
 
 
489 aa  334  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  43.97 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  38.75 
 
 
507 aa  317  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  44.64 
 
 
479 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  42.53 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  40.04 
 
 
472 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  44.79 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  40.56 
 
 
507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  40.91 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  39.59 
 
 
483 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  38.33 
 
 
464 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  45.57 
 
 
486 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  38.37 
 
 
495 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.29 
 
 
464 aa  286  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.87 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  37.47 
 
 
484 aa  266  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  34.08 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  28.81 
 
 
455 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  28.81 
 
 
455 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  29.01 
 
 
455 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  29.68 
 
 
504 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  31.17 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  31.53 
 
 
489 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  27.65 
 
 
454 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.45 
 
 
512 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  27.73 
 
 
511 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  29.82 
 
 
461 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.16 
 
 
456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  27.81 
 
 
459 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  29.07 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  28.18 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  28.57 
 
 
457 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  28.9 
 
 
489 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  27.48 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  27.27 
 
 
471 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  29.15 
 
 
470 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  27.94 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  25.73 
 
 
479 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  26.06 
 
 
470 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  24.43 
 
 
446 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  24.43 
 
 
446 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  29.16 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  29.93 
 
 
461 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  27.5 
 
 
450 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  24.01 
 
 
433 aa  123  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  23.79 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  24.01 
 
 
433 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  23.3 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  23.3 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.28 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  23.35 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  23.52 
 
 
433 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  23.96 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  23.96 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  26.16 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.14 
 
 
457 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  27.29 
 
 
456 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  28.43 
 
 
456 aa  104  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  26.46 
 
 
460 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.57 
 
 
459 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.73 
 
 
460 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  26.67 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.15 
 
 
465 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.49 
 
 
850 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.25 
 
 
849 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.68 
 
 
850 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  33.85 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  30.74 
 
 
479 aa  84  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.87 
 
 
851 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.72 
 
 
842 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.85 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  24.07 
 
 
850 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.14 
 
 
850 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.58 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  23.41 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.3 
 
 
844 aa  68.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  22.02 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.94 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.3 
 
 
840 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  29.38 
 
 
487 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.34 
 
 
844 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  24.01 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  27.75 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.98 
 
 
843 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  20.64 
 
 
381 aa  61.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.75 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
369 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.76 
 
 
405 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  25.06 
 
 
362 aa  57.4  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.23 
 
 
385 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.21 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  22.03 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25 
 
 
732 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>