128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7006 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
560 aa  1087    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  56.8 
 
 
493 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  46.39 
 
 
469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  49.35 
 
 
489 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  47.33 
 
 
479 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  45.97 
 
 
464 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.97 
 
 
464 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.41 
 
 
464 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  47.17 
 
 
490 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  46.14 
 
 
474 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.73 
 
 
486 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  46.09 
 
 
488 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  38.74 
 
 
472 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  39.91 
 
 
507 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  39.42 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  41.2 
 
 
464 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  41.67 
 
 
486 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  41.22 
 
 
483 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  41.54 
 
 
484 aa  296  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.02 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.27 
 
 
455 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  40.4 
 
 
495 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  37.04 
 
 
520 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  30.11 
 
 
484 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.62 
 
 
512 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  30.41 
 
 
504 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  29.4 
 
 
455 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  30.41 
 
 
455 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  29.98 
 
 
455 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  30.27 
 
 
461 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.92 
 
 
456 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  29.32 
 
 
454 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  28.87 
 
 
471 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  28.87 
 
 
471 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  28.57 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  28.17 
 
 
457 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  28.22 
 
 
459 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  26.4 
 
 
511 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  29.42 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  27.98 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  25.91 
 
 
470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  29.93 
 
 
470 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  22.47 
 
 
446 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  22.47 
 
 
446 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  25.58 
 
 
479 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  37.01 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  27.43 
 
 
470 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  36.22 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  37.3 
 
 
487 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  22.3 
 
 
433 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  26.81 
 
 
451 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  21.85 
 
 
433 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  21.63 
 
 
433 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  21.63 
 
 
433 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  21.63 
 
 
433 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  21.63 
 
 
433 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  27.95 
 
 
461 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  21.63 
 
 
433 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  21.19 
 
 
433 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  25.49 
 
 
450 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  20.97 
 
 
433 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.91 
 
 
459 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  27.19 
 
 
530 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.16 
 
 
457 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.97 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.16 
 
 
465 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  28.93 
 
 
456 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  27.25 
 
 
460 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  27.48 
 
 
456 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.88 
 
 
460 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  25.7 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.12 
 
 
850 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.25 
 
 
851 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.38 
 
 
849 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.5 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  26.62 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  33.76 
 
 
518 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.19 
 
 
842 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  20.46 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  26.6 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.5 
 
 
840 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.65 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  26.48 
 
 
850 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  26.61 
 
 
850 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  22.31 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.75 
 
 
382 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  23.16 
 
 
426 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.36 
 
 
732 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.12 
 
 
369 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  23.99 
 
 
388 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.7 
 
 
843 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  21.57 
 
 
385 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.32 
 
 
385 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  31.33 
 
 
432 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  30.45 
 
 
371 aa  57  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  31.08 
 
 
381 aa  57  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  25.39 
 
 
822 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.47 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.21 
 
 
844 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  25.82 
 
 
410 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>