140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1780 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 488 aa  939    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  54.6 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  49.37 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  50.92 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  46.09 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.89 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  49.24 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.24 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  44.49 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  46.42 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  44.28 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  43.17 
 
 		 484 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  47.36 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  49.1 
 
 		 490 aa  345  8e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  46.78 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.04 
 
 		 560 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.42 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  44.08 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  42.92 
 
 		 472 aa  336  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.13 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.07 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  43.24 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  34.07 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  31 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  29.65 
 
 		 451 aa  147  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  30.67 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  28.6 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  28.48 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  27.52 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  27.81 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  25.45 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  28.14 
 
 		 454 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  28.63 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.73 
 
 		 456 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  28.61 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  27.48 
 
 		 471 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  27.45 
 
 		 470 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  27.46 
 
 		 484 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  28.6 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  27.27 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.82 
 
 		 457 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  27.12 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  27.61 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  35.59 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  30.63 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  35.17 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  36.29 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  24.79 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  21.49 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  21.49 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.45 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.27 
 
 		 512 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  26.13 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  29.2 
 
 		 460 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  28.79 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  20.9 
 
 		 433 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  21.24 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  21.03 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  20.65 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  20.65 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  28.06 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  20.6 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  20.6 
 
 		 433 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  20.6 
 
 		 433 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.08 
 
 		 433 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 459 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  20.17 
 
 		 433 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  31.64 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  32.93 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.99 
 
 		 850 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  26.96 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.19 
 
 		 849 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.6 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.6 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  24.36 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.71 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  23.85 
 
 		 840 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  24.8 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.54 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.07 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.91 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.51 
 
 		 842 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  28.63 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.78 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  27.06 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.92 
 
 		 843 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  28.57 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.9 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  24.39 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.18 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  19.69 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  24.42 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.04 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  22.78 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.6 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  23.71 
 
 		 822 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.45 
 
 		 728 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 1117 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>