116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2252 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 
520 aa  1001    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.85 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.96 
 
 
560 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  31.69 
 
 
469 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.59 
 
 
464 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  34.79 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.79 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.14 
 
 
489 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  28.98 
 
 
472 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  30.95 
 
 
474 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  32.53 
 
 
488 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  30.41 
 
 
461 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.06 
 
 
456 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  29.36 
 
 
483 aa  153  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.19 
 
 
464 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  31.16 
 
 
486 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  34.1 
 
 
490 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.08 
 
 
455 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  29.61 
 
 
464 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  29.61 
 
 
484 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  28.45 
 
 
507 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  28.11 
 
 
495 aa  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  29.02 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  24.55 
 
 
433 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  30.62 
 
 
479 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  24.26 
 
 
433 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  24.49 
 
 
433 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  24.26 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  23.86 
 
 
433 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  24.32 
 
 
433 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.37 
 
 
512 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  24.32 
 
 
433 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  24.32 
 
 
433 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  26.97 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.57 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  23.64 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.09 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  26.83 
 
 
455 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  26.86 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  27.5 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  26.1 
 
 
454 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  26.44 
 
 
459 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  25.97 
 
 
484 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  27.59 
 
 
471 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  24.95 
 
 
487 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  24.48 
 
 
489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  26.26 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  26.55 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  26.97 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.84 
 
 
457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  25.71 
 
 
457 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  27.15 
 
 
479 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  26.62 
 
 
456 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  24.41 
 
 
479 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  26.57 
 
 
470 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  25.57 
 
 
470 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  24.42 
 
 
470 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  23.21 
 
 
450 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  22.1 
 
 
446 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  22.1 
 
 
446 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  31.38 
 
 
504 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.98 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  27.52 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  25.24 
 
 
458 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  25.81 
 
 
460 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.31 
 
 
460 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  24.63 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  23.3 
 
 
511 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.77 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  26.89 
 
 
491 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  26.67 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.52 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  30.12 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.63 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.95 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  21.5 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.13 
 
 
840 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  26.86 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  26.86 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  21.57 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.94 
 
 
435 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  25 
 
 
844 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.41 
 
 
409 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.06 
 
 
851 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  27.91 
 
 
530 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.05 
 
 
425 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.72 
 
 
850 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.88 
 
 
849 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.24 
 
 
381 aa  60.1  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  23.11 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.73 
 
 
371 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.45 
 
 
850 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  21.85 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  22.94 
 
 
783 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  20.73 
 
 
384 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.92 
 
 
842 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  20.09 
 
 
391 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  24.24 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.89 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.97 
 
 
405 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>