150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2923 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  904    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  97.61 
 
 		 460 aa  808    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  86.49 
 
 		 456 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  70.02 
 
 		 459 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  67.81 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  46.83 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  43.68 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  48.73 
 
 		 456 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  41.46 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  42.69 
 
 		 479 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  40.61 
 
 		 518 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  35.33 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  35.62 
 
 		 455 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  34.89 
 
 		 455 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  35.97 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  32.29 
 
 		 459 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  34.2 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  34.75 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  34.62 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  35.63 
 
 		 461 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  35.53 
 
 		 471 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  34.26 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  35.31 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.41 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  32.97 
 
 		 484 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  33.61 
 
 		 504 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  35.27 
 
 		 457 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  33.63 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.75 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  33.26 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  34.13 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  31.18 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  32.39 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  43.32 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.92 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  30.82 
 
 		 489 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  29.49 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  29.21 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  28.99 
 
 		 433 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  28.79 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  28.38 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  27.93 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  28.38 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  27.93 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  28.15 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  28.15 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  30.88 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  23.23 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  23.23 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  27.13 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.54 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  26.12 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  26.8 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  25.43 
 
 		 507 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  27.06 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  25.22 
 
 		 520 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.38 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.25 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.2 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.7 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  27.56 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.91 
 
 		 560 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  25.12 
 
 		 507 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  25.11 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.34 
 
 		 455 aa  90.1  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  27.29 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  23.72 
 
 		 388 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  27.25 
 
 		 483 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.51 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.02 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  28.29 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  24.68 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.43 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  22.45 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.65 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  27.14 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  30.43 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  25.98 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.67 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  22.22 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  25.13 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.12 
 
 		 851 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.01 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.24 
 
 		 849 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.14 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  20.67 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.74 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.24 
 
 		 850 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.4 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.55 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.48 
 
 		 850 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.55 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.61 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.29 
 
 		 403 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  31.48 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.02 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25.86 
 
 		 783 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>