128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3977 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 
483 aa  951    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  51.17 
 
 
464 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  50.74 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.74 
 
 
464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  51.4 
 
 
479 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  43.01 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  43.58 
 
 
474 aa  333  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  43.5 
 
 
490 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  42.13 
 
 
464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  40.04 
 
 
472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  43.66 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.33 
 
 
464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  42.62 
 
 
488 aa  310  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.75 
 
 
455 aa  300  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  39.35 
 
 
507 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  38.17 
 
 
507 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  39.53 
 
 
495 aa  293  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.7 
 
 
560 aa  289  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  39.6 
 
 
484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.03 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  40.32 
 
 
489 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  41.15 
 
 
486 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  30.56 
 
 
484 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  30.02 
 
 
520 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  30.65 
 
 
504 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  29.41 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  30.2 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  28.82 
 
 
455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  28.48 
 
 
455 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.62 
 
 
512 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.08 
 
 
456 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  27.47 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  28.48 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  29.07 
 
 
454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  29.1 
 
 
489 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  28.29 
 
 
451 aa  136  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  28.08 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  27.84 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  27.62 
 
 
471 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  30.04 
 
 
456 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  29.23 
 
 
491 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  29.34 
 
 
489 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  27.43 
 
 
457 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.52 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  27.18 
 
 
511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  26 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  28.14 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  27.72 
 
 
479 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  27.68 
 
 
470 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  24.52 
 
 
450 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  28.65 
 
 
530 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  23.08 
 
 
446 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  23.08 
 
 
446 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  27.03 
 
 
470 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  24.78 
 
 
470 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  28.75 
 
 
461 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.93 
 
 
842 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.57 
 
 
840 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  23.14 
 
 
433 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  23.31 
 
 
433 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  23.14 
 
 
433 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.59 
 
 
850 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  23.53 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.17 
 
 
849 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  22.32 
 
 
433 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  23.09 
 
 
433 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  34.94 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.26 
 
 
851 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.68 
 
 
850 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  23.09 
 
 
433 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  23.31 
 
 
433 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  23.31 
 
 
433 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  26.58 
 
 
458 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.81 
 
 
433 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.47 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  28.18 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.45 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.07 
 
 
843 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  27.09 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  26.37 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  24.81 
 
 
783 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.48 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  22.94 
 
 
850 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.21 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  26.35 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  26.35 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  23.26 
 
 
822 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.86 
 
 
844 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  27.27 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  22.16 
 
 
850 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.06 
 
 
840 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  25.45 
 
 
844 aa  60.1  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.94 
 
 
385 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.03 
 
 
718 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  22.47 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  22.63 
 
 
405 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.1 
 
 
369 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.49 
 
 
732 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  27.68 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>