174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2319 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  100 
 
 
461 aa  932    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  40.49 
 
 
455 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  40.45 
 
 
455 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  38.81 
 
 
459 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  40.27 
 
 
455 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  38.5 
 
 
454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  36.79 
 
 
484 aa  309  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  37.72 
 
 
457 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.69 
 
 
456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  38.41 
 
 
472 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  37.28 
 
 
457 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  37.58 
 
 
471 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  37.29 
 
 
471 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  37.58 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.56 
 
 
512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  35.47 
 
 
487 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  34.39 
 
 
504 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  37.17 
 
 
456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.08 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  33.81 
 
 
489 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  35.53 
 
 
470 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  33.61 
 
 
491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  38.13 
 
 
518 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.47 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  37.64 
 
 
479 aa  260  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  37.59 
 
 
456 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  31.3 
 
 
479 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.88 
 
 
460 aa  239  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  36.11 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  32.54 
 
 
530 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  35.1 
 
 
470 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  34.22 
 
 
458 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  31.91 
 
 
489 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  31.79 
 
 
450 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.82 
 
 
465 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  30.87 
 
 
511 aa  189  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  33.01 
 
 
461 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  27.7 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  26.18 
 
 
446 aa  166  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  26.18 
 
 
446 aa  166  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.23 
 
 
433 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  27.48 
 
 
433 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.58 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  27.13 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.08 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  29.93 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  27.01 
 
 
433 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.7 
 
 
433 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  32.91 
 
 
464 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.91 
 
 
464 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  27.25 
 
 
433 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  27.35 
 
 
433 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  27.35 
 
 
433 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  30.41 
 
 
520 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.9 
 
 
560 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  29.06 
 
 
472 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.79 
 
 
489 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  31.45 
 
 
490 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  29.3 
 
 
464 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.85 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  27.77 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.62 
 
 
486 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.85 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  27.92 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.49 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  28.29 
 
 
479 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  28.96 
 
 
495 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  30.58 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  28.82 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  25.84 
 
 
507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  29.3 
 
 
486 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  26.2 
 
 
507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.2 
 
 
405 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25.61 
 
 
394 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.63 
 
 
850 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.86 
 
 
842 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.94 
 
 
840 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  26.07 
 
 
850 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.4 
 
 
850 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.08 
 
 
851 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  24.34 
 
 
822 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.47 
 
 
849 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.47 
 
 
850 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.28 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  25.74 
 
 
406 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.45 
 
 
843 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.41 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.84 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.18 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.29 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.75 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.12 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  31.98 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.53 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.28 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.37 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.13 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>