More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4040 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  43.56 
 
 
388 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  40.83 
 
 
410 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.36 
 
 
405 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.27 
 
 
385 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.92 
 
 
385 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  36.1 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  36.05 
 
 
360 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  31.49 
 
 
371 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.36 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.88 
 
 
369 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  34.23 
 
 
425 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  30.94 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  33.87 
 
 
381 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  33.08 
 
 
384 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  34.55 
 
 
410 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  33.86 
 
 
385 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 
1117 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.08 
 
 
388 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  33.6 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  30.11 
 
 
406 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  33.67 
 
 
437 aa  179  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.89 
 
 
840 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  28.18 
 
 
850 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.22 
 
 
842 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  28.18 
 
 
850 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.42 
 
 
851 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  26.83 
 
 
844 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.42 
 
 
850 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.23 
 
 
850 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.89 
 
 
849 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.17 
 
 
482 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  26.03 
 
 
783 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.81 
 
 
843 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  25.97 
 
 
381 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  28.65 
 
 
381 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  32.53 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.42 
 
 
840 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  27.41 
 
 
822 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  29.01 
 
 
388 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  26.96 
 
 
397 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  27.37 
 
 
362 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.65 
 
 
844 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  25.81 
 
 
380 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  25.81 
 
 
380 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  26.02 
 
 
381 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.26 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25.21 
 
 
444 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.56 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.84 
 
 
435 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  23.74 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  23.62 
 
 
398 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.89 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  24.67 
 
 
374 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.29 
 
 
849 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.32 
 
 
885 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  22.47 
 
 
455 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  22.34 
 
 
455 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  26.51 
 
 
381 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  27.22 
 
 
379 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  23.62 
 
 
454 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  22.12 
 
 
380 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  22.73 
 
 
455 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  26.54 
 
 
370 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.18 
 
 
403 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.48 
 
 
456 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  20.71 
 
 
484 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  24.13 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  24.19 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.76 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  23.06 
 
 
457 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  23.76 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  23.31 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  22.76 
 
 
408 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  21.04 
 
 
471 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  21.29 
 
 
471 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  26.13 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  24.66 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  23.12 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  22.74 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.75 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  24.19 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  21.81 
 
 
439 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  23.18 
 
 
451 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  25.37 
 
 
504 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  23.59 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  22.63 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  22.28 
 
 
461 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  27.74 
 
 
371 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.9 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.22 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  20.15 
 
 
470 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  23.19 
 
 
433 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  21.9 
 
 
433 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  21.98 
 
 
408 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  20.25 
 
 
479 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  24.54 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.94 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  22.41 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.98 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>