248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1579 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 		 385 aa  789    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  60.43 
 
 		 385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  58.91 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  42.62 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  41.69 
 
 		 391 aa  291  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  42.33 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  42.26 
 
 		 1117 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  40.87 
 
 		 385 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.56 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  38.99 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  38.48 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  40.63 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.58 
 
 		 482 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.97 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  38.19 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  35.61 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  33.42 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  31.17 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  30.73 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.08 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  30.35 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  27.42 
 
 		 381 aa  139  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.39 
 
 		 850 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.14 
 
 		 849 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.07 
 
 		 851 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.75 
 
 		 850 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.46 
 
 		 842 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.98 
 
 		 840 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.69 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  26.01 
 
 		 783 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  26.1 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  27.79 
 
 		 850 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.22 
 
 		 843 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  26.05 
 
 		 844 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  27.06 
 
 		 850 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  27.51 
 
 		 822 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  23.54 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  23.97 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  23.56 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  26.13 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  24.35 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  23.3 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  22.22 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  23.94 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.6 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.08 
 
 		 840 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  23.2 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.93 
 
 		 849 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.56 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  24.22 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  24.2 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.64 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  22.77 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  21.09 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  21.09 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  22.6 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  28.76 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25 
 
 		 885 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  21.55 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.58 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.64 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.6 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.35 
 
 		 844 aa  79.7  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  21.95 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  22.81 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  22.96 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.37 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  23.44 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  22.91 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  25 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  25.45 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  24.44 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  25.89 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  22.2 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  21.84 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  22.63 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  21.84 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  23.47 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.68 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 539 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  22.79 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  24.56 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  24.02 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  22.3 
 
 		 446 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.31 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  21.81 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.98 
 
 		 892 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  22.82 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.71 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  22.67 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.31 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  26.32 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  24.14 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  24 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.04 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>