135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0153 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  86.65 
 
 
411 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  87.65 
 
 
412 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
412 aa  814    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  87.62 
 
 
412 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  65.69 
 
 
408 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  65.4 
 
 
408 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.33 
 
 
412 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  54.91 
 
 
428 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  54.19 
 
 
403 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  39.02 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.66 
 
 
433 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  42.22 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  41.22 
 
 
430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  43.81 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  39.95 
 
 
428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  40.89 
 
 
433 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.25 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  39.13 
 
 
392 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  39.13 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  38.62 
 
 
382 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  36.19 
 
 
427 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  30.86 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  30.05 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  30.53 
 
 
381 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  25.23 
 
 
432 aa  117  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  24.94 
 
 
426 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  25.19 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25.39 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  25.06 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.1 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  26.04 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.58 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  22.44 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  28.14 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  27.96 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.4 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  26.21 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.51 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.87 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  26.36 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.21 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  21.29 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.1 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.92 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.04 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  23.31 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  23.17 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.79 
 
 
525 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  24.3 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.04 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.31 
 
 
840 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.95 
 
 
842 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.21 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.56 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.41 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  25.86 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  22.44 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.71 
 
 
851 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  25.6 
 
 
543 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  28.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.01 
 
 
849 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.96 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  21.18 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.64 
 
 
850 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  22.6 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.13 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.42 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.51 
 
 
397 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.8 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.46 
 
 
486 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.15 
 
 
850 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  21.35 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  29.39 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  23.76 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.28 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  26.85 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  24.81 
 
 
496 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.85 
 
 
369 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  22.73 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.09 
 
 
398 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  25.65 
 
 
844 aa  56.6  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  23.73 
 
 
381 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  24.66 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  23.51 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  22.55 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  20.84 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.59 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.66 
 
 
356 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  22.39 
 
 
783 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  21 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.46 
 
 
533 aa  53.9  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  23.04 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  25.5 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  24.62 
 
 
850 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.6 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.9 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.07 
 
 
534 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.7 
 
 
526 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>