232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07035 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  100 
 
 
377 aa  776    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.84 
 
 
385 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.99 
 
 
385 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.2 
 
 
388 aa  272  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  36.6 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  38.04 
 
 
410 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.26 
 
 
382 aa  228  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  35.62 
 
 
437 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  34.03 
 
 
394 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.69 
 
 
369 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 
1117 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.55 
 
 
405 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  32.71 
 
 
425 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.49 
 
 
482 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  31.84 
 
 
406 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  31.55 
 
 
384 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  32.97 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.53 
 
 
369 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  29.47 
 
 
410 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  29.23 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  30.03 
 
 
360 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  27.25 
 
 
371 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  28.42 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  26.74 
 
 
459 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  25.82 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.6 
 
 
849 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.34 
 
 
850 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  25.47 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.68 
 
 
851 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.61 
 
 
397 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.69 
 
 
850 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.11 
 
 
840 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25.34 
 
 
783 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.81 
 
 
843 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.53 
 
 
850 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  25.13 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  24.59 
 
 
444 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.06 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.27 
 
 
850 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  24.13 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.14 
 
 
842 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  25.48 
 
 
822 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  24.62 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  21.52 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  21.52 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.66 
 
 
844 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  23.01 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.38 
 
 
885 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  23.39 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  24.42 
 
 
385 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.61 
 
 
844 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  25.77 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  23.72 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.05 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.06 
 
 
849 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  23.16 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  23.61 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  22.22 
 
 
469 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.6 
 
 
533 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  26.58 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.98 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  25.56 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.13 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  20.56 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.43 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  22.19 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  22.25 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  25 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  19.89 
 
 
538 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  22.39 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  21.97 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  24.87 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  24.16 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.98 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  21.95 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  21.95 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.09 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.71 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.19 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  22.82 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  22.28 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  22.57 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  22.92 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.05 
 
 
530 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  25.89 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  22.44 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.42 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.17 
 
 
840 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.42 
 
 
539 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.57 
 
 
530 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  22.44 
 
 
484 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  23.71 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.24 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.98 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  21.48 
 
 
451 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  20 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.55 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  23.62 
 
 
457 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  26.07 
 
 
459 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>