170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1802 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  787    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  42.08 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1810  PepSY-associated TM helix family protein  40.1 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  34.21 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  32.89 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  30.69 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  29.47 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.87 
 
 		 843 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  26.98 
 
 		 850 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  25.99 
 
 		 850 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  26.68 
 
 		 783 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.78 
 
 		 851 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.61 
 
 		 842 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.52 
 
 		 850 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.78 
 
 		 850 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.52 
 
 		 849 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  26.86 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  24.93 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25 
 
 		 840 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  25.44 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  25.44 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  25.54 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.42 
 
 		 844 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  25.35 
 
 		 822 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.62 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.76 
 
 		 849 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.23 
 
 		 844 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.03 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.76 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  25.66 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.9 
 
 		 840 aa  92.8  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.35 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.83 
 
 		 885 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  25.26 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  23.58 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  23.1 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.19 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.64 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  25.1 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.12 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  22.45 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.33 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.89 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  21.89 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.63 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  24.49 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  25.68 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  24.18 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  21.56 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.65 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1117 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  22.95 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  24.37 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.56 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.21 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  22.78 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  24.31 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.25 
 
 		 892 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  19.55 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.34 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  22.67 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  22.76 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.04 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.76 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  22.39 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.92 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.47 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  25.21 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  24.04 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  24.42 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  28.84 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  28.37 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  21.61 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  21.99 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  21.25 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  29.39 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.02 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.91 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  24 
 
 		 732 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  28.95 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  20.63 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  23.08 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2884  hypothetical protein  21.3 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179346  hitchhiker  0.000404668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  25.45 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.62 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.62 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  22.92 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  23 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  20.8 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.51 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  25.96 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  29.13 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  21.5 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  29.13 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.42 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>