238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0667 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 405 aa  810    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  69.29 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  30.21 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  31.19 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  30.41 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  30.92 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.59 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  30.38 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  30.73 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  30.39 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  29.16 
 
 		 433 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.05 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  29.7 
 
 		 433 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  29.93 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  27.15 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  29.9 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.73 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  27.72 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  27.88 
 
 		 439 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  30.47 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  29.62 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  29.35 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  28.76 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  25.32 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25.12 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.58 
 
 		 842 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.36 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  27.99 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.97 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.06 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.56 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.58 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.05 
 
 		 850 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  26.94 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  28.12 
 
 		 850 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.34 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.12 
 
 		 850 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.37 
 
 		 849 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  23.13 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0028  PepSY-associated TM helix  32.13 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522005  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  26.77 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.35 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.09 
 
 		 840 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  27.34 
 
 		 850 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  27.36 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  21.84 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.12 
 
 		 851 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.93 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  27.82 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  23.54 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  27.75 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  23.41 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  27.53 
 
 		 783 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.46 
 
 		 840 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 		 843 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  26.23 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.08 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  28.07 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  28.07 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.72 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  23.69 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.11 
 
 		 844 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.7 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  23.73 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.18 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  22.31 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  24.69 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  23.93 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  25.97 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.81 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  24.82 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  25.45 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.69 
 
 		 885 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.68 
 
 		 844 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.15 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  27.38 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  21.79 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  24.48 
 
 		 507 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  20.64 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  24.56 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  25.82 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  21.39 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  24.18 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.17 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  24.43 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2884  hypothetical protein  22.39 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179346  hitchhiker  0.000404668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.64 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.71 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  23.83 
 
 		 540 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.35 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.47 
 
 		 822 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  26.49 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>