145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0526 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 
457 aa  923    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  50.57 
 
 
458 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  48.83 
 
 
459 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  45.66 
 
 
451 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  47.6 
 
 
456 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  47.02 
 
 
460 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  46.42 
 
 
456 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  44.49 
 
 
472 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  48.1 
 
 
460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  40.69 
 
 
518 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  42.65 
 
 
479 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  38.4 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  37.61 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  36.89 
 
 
457 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  35.78 
 
 
455 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  35.08 
 
 
455 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  35.08 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  36.15 
 
 
454 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  35.79 
 
 
471 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  35.48 
 
 
471 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  37.78 
 
 
457 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  35.08 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.85 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  35.36 
 
 
470 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  36.51 
 
 
487 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  35.44 
 
 
491 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  34.26 
 
 
504 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  34.16 
 
 
479 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  33.97 
 
 
470 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  34.83 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  34.99 
 
 
470 aa  232  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.21 
 
 
512 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  33.78 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  31.94 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.63 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  42.91 
 
 
530 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  28.18 
 
 
489 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  28.1 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  30.08 
 
 
461 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  27.67 
 
 
433 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.19 
 
 
433 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.99 
 
 
433 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  26.71 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  27.02 
 
 
433 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  26.91 
 
 
433 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  26.91 
 
 
433 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  26.8 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  26.8 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  24.67 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  24.67 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  26.52 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  24.56 
 
 
469 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  25.84 
 
 
520 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  25.49 
 
 
488 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.16 
 
 
489 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  24.4 
 
 
464 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.4 
 
 
464 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.95 
 
 
493 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  24.35 
 
 
484 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.31 
 
 
464 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  23.25 
 
 
507 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.1 
 
 
486 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  23.32 
 
 
472 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  27.37 
 
 
474 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  22.47 
 
 
495 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.98 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  23.43 
 
 
507 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.97 
 
 
560 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.52 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.01 
 
 
464 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.61 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  25.37 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.93 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  21.88 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.43 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  23.92 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.74 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.18 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  27.41 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  25.38 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  24.47 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  23.46 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.68 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  23 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  26.87 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.9 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.84 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  20.77 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  24.69 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.39 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.53 
 
 
482 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  22.19 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  23.37 
 
 
384 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  24.69 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.07 
 
 
840 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  24 
 
 
842 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.34 
 
 
843 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  22.94 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>