172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2702 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  68.63 
 
 
512 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  100 
 
 
487 aa  971    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  70.14 
 
 
504 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  91.45 
 
 
491 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  92.23 
 
 
489 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  39.8 
 
 
471 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  39.79 
 
 
471 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  38.35 
 
 
454 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  37.61 
 
 
455 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  38.54 
 
 
455 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  37.18 
 
 
455 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  36.17 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  37.2 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.94 
 
 
456 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  36.51 
 
 
457 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  35.38 
 
 
484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  35.68 
 
 
461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  34.24 
 
 
451 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  37.47 
 
 
479 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.51 
 
 
457 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  36.65 
 
 
472 aa  259  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  36.98 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  36.38 
 
 
458 aa  253  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  37.23 
 
 
456 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  36.48 
 
 
456 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.54 
 
 
460 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.38 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  34.4 
 
 
470 aa  236  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  32.77 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  33.55 
 
 
470 aa  219  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  35.23 
 
 
518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  31.52 
 
 
489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  28.97 
 
 
479 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  30.61 
 
 
450 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  30.43 
 
 
511 aa  193  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  32.47 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.22 
 
 
465 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  27.64 
 
 
433 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  28.54 
 
 
469 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  27.64 
 
 
433 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  27.22 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  27.16 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.22 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.37 
 
 
433 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  30.12 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  27 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  27.22 
 
 
433 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  27 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  27 
 
 
433 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  25.46 
 
 
446 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  25.46 
 
 
446 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  28.75 
 
 
472 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.04 
 
 
493 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  29.25 
 
 
464 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.1 
 
 
489 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.6 
 
 
455 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.57 
 
 
464 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.21 
 
 
560 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  30.99 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  27.98 
 
 
464 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.98 
 
 
464 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  29.12 
 
 
507 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  28.69 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  29.33 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.99 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  28.66 
 
 
479 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  37.77 
 
 
530 aa  126  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  25.37 
 
 
520 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.11 
 
 
405 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  29.13 
 
 
483 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  38.03 
 
 
397 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.06 
 
 
486 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  35.94 
 
 
381 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  27.4 
 
 
371 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  33.33 
 
 
490 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  27 
 
 
851 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.83 
 
 
850 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  21.46 
 
 
394 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.48 
 
 
849 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.39 
 
 
840 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  34.62 
 
 
488 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  28.47 
 
 
850 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  27.98 
 
 
850 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.36 
 
 
850 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  28.41 
 
 
398 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.73 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.74 
 
 
381 aa  94.7  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.1 
 
 
369 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.4 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  25.85 
 
 
362 aa  90.9  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  27.01 
 
 
783 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 
842 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.6 
 
 
398 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20 
 
 
369 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.95 
 
 
403 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.97 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.93 
 
 
843 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  29.33 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.18 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.77 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>