149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2883 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  907    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  43.18 
 
 
489 aa  355  8.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  38.88 
 
 
461 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0526  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.78 
 
 
457 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.6 
 
 
456 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  31.78 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  31.71 
 
 
484 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  30.13 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  31.83 
 
 
451 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.86 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  30.39 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  30.02 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  32.07 
 
 
461 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  29.42 
 
 
455 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  31.37 
 
 
457 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  29.46 
 
 
504 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  30.34 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  29.3 
 
 
487 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.19 
 
 
512 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4213  integral membrane protein  28.17 
 
 
470 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  27.69 
 
 
491 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  27.88 
 
 
489 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  33.33 
 
 
456 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  31.8 
 
 
456 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  30.11 
 
 
471 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  32.9 
 
 
458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  29.26 
 
 
470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  33.1 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  28.87 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.26 
 
 
460 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  28.13 
 
 
479 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0032  hypothetical protein  30.27 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.924965  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2067  PepSY-associated TM helix domain protein  28.79 
 
 
472 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  28.99 
 
 
470 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02130  sulfite reductase  35.37 
 
 
530 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0161924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  36.07 
 
 
479 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  36.61 
 
 
518 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0373  hypothetical protein  27.01 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4891  hypothetical protein  27.01 
 
 
433 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3560  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.95 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.668518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4489  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  26.56 
 
 
433 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4901  hypothetical protein  26.56 
 
 
433 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4866  hypothetical protein  26.67 
 
 
433 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4507  sulfite reductase [NADPH], flavoprotein, alpha subunit  26.56 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4875  hypothetical protein  26.56 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4584  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.34 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  28.09 
 
 
464 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.09 
 
 
464 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.95 
 
 
464 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4651  hypothetical protein  26.34 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5006  hypothetical protein  26.34 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  28.25 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  24.33 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.17 
 
 
493 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3648  putative iron-regulated membrane protein  26.06 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.39 
 
 
489 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1780  PepSY-associated TM helix domain protein  28.36 
 
 
488 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.40116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  23.32 
 
 
520 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7006  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.62 
 
 
560 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103084  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3977  PepSY-associated TM helix domain protein  25.83 
 
 
483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1654  PepSY-associated TM helix domain protein  26 
 
 
479 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1502  peptidase  23.48 
 
 
446 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1531  peptidase  23.48 
 
 
446 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11710  uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.3 
 
 
486 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0768282  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 
464 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355321  normal  0.221484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  26.95 
 
 
474 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.05 
 
 
455 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  27.03 
 
 
490 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2830  PepSY-associated TM helix domain protein  24.63 
 
 
507 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  24.03 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1603  putative iron-regulated membrane protein  25 
 
 
495 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  22.83 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.09 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1842  PepSY-associated TM helix domain protein  25.69 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.829813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.44 
 
 
397 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.17 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2525  PepSY-associated TM helix domain protein  24.19 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.65 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.37 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  18.96 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.75 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  24.68 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.67 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.6 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  22.16 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.1 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  22.16 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  25.75 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  25.75 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.48 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  20.05 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  21.65 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  19.95 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.65 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.49 
 
 
850 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  24.68 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.19 
 
 
850 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.01 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  25.25 
 
 
362 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.79 
 
 
843 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>