221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2514 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 
437 aa  892    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  62.84 
 
 
410 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  50.36 
 
 
1117 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  45.8 
 
 
391 aa  340  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.35 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  43.6 
 
 
388 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.68 
 
 
385 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.92 
 
 
385 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  39.28 
 
 
385 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  39.36 
 
 
425 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  36.73 
 
 
394 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.36 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.34 
 
 
382 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.32 
 
 
369 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  35.81 
 
 
406 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  36.01 
 
 
377 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  33.01 
 
 
410 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.68 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  31.53 
 
 
459 aa  180  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  31.7 
 
 
388 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  30.42 
 
 
384 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  30.03 
 
 
360 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  30.32 
 
 
381 aa  153  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.02 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.24 
 
 
842 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  26.58 
 
 
388 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.6 
 
 
851 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.94 
 
 
843 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.58 
 
 
397 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.33 
 
 
840 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.65 
 
 
850 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.05 
 
 
849 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  26.47 
 
 
783 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.05 
 
 
850 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.6 
 
 
822 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  26.79 
 
 
381 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.81 
 
 
850 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.81 
 
 
844 aa  90.1  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  26.1 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  24.44 
 
 
398 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  24.13 
 
 
850 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  24.35 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.03 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  24.38 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  22.57 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.7 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.02 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
526 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  25.06 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  23.68 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  24.26 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
403 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.68 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.13 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.04 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.14 
 
 
849 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.94 
 
 
844 aa  73.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.57 
 
 
840 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.75 
 
 
575 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.8 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.81 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  24.88 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  23.06 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  24.34 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.5 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  20.37 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.76 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.49 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  23.25 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  23.1 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  22.14 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  24.43 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  23.91 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  21.79 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  23.04 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.93 
 
 
403 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  24.62 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  22.84 
 
 
555 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.37 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  20.88 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  23.21 
 
 
540 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  23.48 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.02 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  23.79 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.94 
 
 
539 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  23.72 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.44 
 
 
892 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.41 
 
 
575 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  21.58 
 
 
428 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  22.51 
 
 
479 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.79 
 
 
539 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  23.22 
 
 
397 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.69 
 
 
885 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  24.03 
 
 
398 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  23.45 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.64 
 
 
575 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  20.9 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  24.76 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  30.26 
 
 
521 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  27.63 
 
 
396 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>