149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4558 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 409 aa  816    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  33.66 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  30.89 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  32.65 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.24 
 
 		 842 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  29.82 
 
 		 783 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.41 
 
 		 851 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  28.64 
 
 		 850 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.81 
 
 		 850 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.81 
 
 		 849 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  27.96 
 
 		 850 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.88 
 
 		 850 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  32.08 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  26.73 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  22.68 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  29.5 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.42 
 
 		 840 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  32.11 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  24.04 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  27.84 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.21 
 
 		 844 aa  99.8  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  28.52 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.57 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.84 
 
 		 843 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  31.71 
 
 		 844 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.43 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.96 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.6 
 
 		 385 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1117 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.37 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.75 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.84 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.66 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.06 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  24.88 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.51 
 
 		 840 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.48 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  23.34 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  24.47 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  26.09 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  23.19 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  26 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.94 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  22.42 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.06 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  27.15 
 
 		 822 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  23.61 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.04 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  23.62 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  24.15 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4790  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.81 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  23.19 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  23.1 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  25.39 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  25.24 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  30.32 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  22.47 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  19.65 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  24.94 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  25.36 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  25.36 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  25.65 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  23.96 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.79 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  25.8 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.54 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.34 
 
 		 885 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  25 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.06 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.02 
 
 		 892 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.3 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2252  PepSY-associated TM helix domain protein  25.41 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  23.96 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4082  PepSY-associated TM helix domain protein  24.37 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1630  hypothetical protein  26.27 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0107193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.32 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  25.3 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0586  membrane protein  22.14 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.96 
 
 		 849 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  20.91 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  24.17 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  23.83 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  26.94 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  22.44 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  24.08 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.08 
 
 		 732 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4207  peptidase  28 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  24.08 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  19.91 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  25.53 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  22.03 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  22.67 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5663  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  22.03 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4447  peptidase  30.3 
 
 		 518 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.251853  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  22.03 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  25.49 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  21.65 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>