197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2196 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  80.41 
 
 
389 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  96.14 
 
 
389 aa  778    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  96.66 
 
 
389 aa  784    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.41 
 
 
389 aa  675    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.41 
 
 
389 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  83.29 
 
 
389 aa  698    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  61.68 
 
 
390 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  40.58 
 
 
399 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  39.95 
 
 
398 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  39.57 
 
 
403 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  38.48 
 
 
407 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  39.1 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  37.96 
 
 
411 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  38.46 
 
 
397 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  38.21 
 
 
397 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  38.26 
 
 
397 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  37.06 
 
 
397 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2394  PepSY-associated TM helix  34.41 
 
 
393 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  30.11 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  28.01 
 
 
396 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  24.54 
 
 
361 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  26.16 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  23.26 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.24 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.35 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  24.06 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  25.43 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.66 
 
 
385 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.81 
 
 
356 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  26.28 
 
 
408 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  22.4 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.54 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.35 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  25.87 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2723  putative iron-regulated membrane protein  25.63 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  22.81 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.06 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.84 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.51 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.77 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  25.3 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.27 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.12 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  25.45 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0347  hypothetical protein  24.87 
 
 
470 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  23.1 
 
 
502 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.81 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  24 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  24.16 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.61 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.25 
 
 
892 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  25.19 
 
 
641 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.74 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  22.13 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.28 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  23.4 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.06 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.32 
 
 
386 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.17 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.74 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.35 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.4 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.99 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  22.07 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  23.99 
 
 
529 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.75 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.26 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 
1117 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  21.66 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  25.73 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.94 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  25 
 
 
459 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.1 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  24.1 
 
 
370 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  21.46 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.96 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  25.24 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.34 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  22.22 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  20.81 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  20.95 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.56 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.45 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  25.56 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  22.73 
 
 
627 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.39 
 
 
560 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  21.61 
 
 
565 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.51 
 
 
554 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.39 
 
 
560 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  20.88 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  25.89 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.13 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.69 
 
 
575 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.61 
 
 
575 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.47 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  22.71 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  24.1 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  23.46 
 
 
479 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>