33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2399 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2399  Uncharacterized iron-regulated membrane protein-like protein  100 
 
 		 336 aa  680    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25.32 
 
 		 783 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  25.3 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.24 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  22.46 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  26.79 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.25 
 
 		 456 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  28.39 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  19.89 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  28.15 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3353  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.67 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.64 
 
 		 850 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  25.29 
 
 		 471 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2159  peptidase  24.55 
 
 		 474 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  25 
 
 		 850 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  25.29 
 
 		 471 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  21.91 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.62 
 
 		 380 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.54 
 
 		 408 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  23.84 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  25.61 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.26 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  23.5 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  23.03 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  22.99 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  20.59 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  25.45 
 
 		 393 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  20.18 
 
 		 403 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  19.83 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  20.34 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>