151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2169 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  62.72 
 
 
547 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 
534 aa  1098    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  57.74 
 
 
529 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  99.23 
 
 
525 aa  1068    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.81 
 
 
540 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.91 
 
 
539 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.53 
 
 
539 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  48.69 
 
 
539 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  48.98 
 
 
539 aa  524  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  35.05 
 
 
555 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  30.28 
 
 
543 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  29.04 
 
 
519 aa  207  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  28.31 
 
 
540 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  26.11 
 
 
529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.16 
 
 
533 aa  120  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  24.72 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.05 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  24.89 
 
 
641 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.47 
 
 
525 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  23.71 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.34 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.34 
 
 
560 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.88 
 
 
526 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.97 
 
 
560 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  24.22 
 
 
574 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 
554 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.83 
 
 
575 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  24.14 
 
 
539 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.08 
 
 
575 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.4 
 
 
534 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  24.21 
 
 
521 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.78 
 
 
575 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  25.78 
 
 
506 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.82 
 
 
534 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  22.39 
 
 
565 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.81 
 
 
547 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.68 
 
 
529 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  26.73 
 
 
519 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  25.48 
 
 
542 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.29 
 
 
556 aa  100  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.91 
 
 
506 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.82 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  25.3 
 
 
506 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24 
 
 
541 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  24.39 
 
 
519 aa  97.4  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.84 
 
 
530 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  25.26 
 
 
545 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.6 
 
 
530 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.31 
 
 
525 aa  94.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  26.11 
 
 
524 aa  93.6  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  24.91 
 
 
627 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  21.49 
 
 
538 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.86 
 
 
557 aa  91.3  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.27 
 
 
506 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.67 
 
 
518 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.5 
 
 
551 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  23.4 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  23.26 
 
 
540 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  23.16 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.77 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.29 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.6 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  25.53 
 
 
560 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.73 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.94 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.58 
 
 
571 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.74 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  22.72 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  22.74 
 
 
559 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  24.69 
 
 
542 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  23.85 
 
 
496 aa  77  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.57 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  26.06 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  24.48 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.22 
 
 
539 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.77 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.82 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.31 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.12 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.35 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  21.37 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.43 
 
 
405 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.26 
 
 
369 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  29.05 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0219  hypothetical protein  30.71 
 
 
180 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  20.77 
 
 
382 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.95 
 
 
503 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  21.03 
 
 
503 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.03 
 
 
503 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  21.98 
 
 
527 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.03 
 
 
501 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  21.25 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  20.39 
 
 
503 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.98 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  22 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  21.52 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  21.85 
 
 
410 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.62 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  23.7 
 
 
380 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>