143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0495 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 546 aa  1134    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  41.32 
 
 		 518 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 525 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 519 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.6 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  23.62 
 
 		 559 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  27.04 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  23.33 
 
 		 543 aa  120  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  25.94 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  24.77 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 530 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.95 
 
 		 554 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  24.64 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  25.47 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 530 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  23.42 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  22.98 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.27 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  22.39 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.48 
 
 		 575 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  23.09 
 
 		 565 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.87 
 
 		 575 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  24.71 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.01 
 
 		 560 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.61 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.28 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.83 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  21.51 
 
 		 555 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  24.59 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  23.87 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  26.46 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.46 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  23.73 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.02 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.55 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  25.47 
 
 		 519 aa  100  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  23.54 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.34 
 
 		 525 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.16 
 
 		 534 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 539 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  22.67 
 
 		 540 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  23.2 
 
 		 574 aa  97.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  22.48 
 
 		 536 aa  97.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  24.52 
 
 		 542 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.99 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.85 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.8 
 
 		 556 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.44 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.89 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.18 
 
 		 539 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  23 
 
 		 550 aa  93.6  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.29 
 
 		 557 aa  93.6  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.6 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  22.46 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.66 
 
 		 562 aa  90.9  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  23.37 
 
 		 539 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.13 
 
 		 551 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  24.85 
 
 		 476 aa  88.2  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.08 
 
 		 529 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  23.57 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.65 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  22.86 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  21.71 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  26.39 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.1 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.39 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.41 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.53 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  21.71 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  21.88 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.41 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  23.55 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.6 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  21.63 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.25 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.97 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  26.36 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  22.22 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  20.18 
 
 		 559 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.11 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  19.42 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  20.87 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.87 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.32 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.83 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.81 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.17 
 
 		 385 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  22.58 
 
 		 377 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  22.18 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.22 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.09 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  24.59 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  23.19 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  22.53 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.92 
 
 		 377 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>