155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1313 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  80.21 
 
 
559 aa  931    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  99.12 
 
 
565 aa  1164    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  60.49 
 
 
541 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.88 
 
 
560 aa  951    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.53 
 
 
560 aa  949    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  80.88 
 
 
560 aa  950    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  98.26 
 
 
575 aa  1174    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  79.47 
 
 
554 aa  931    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  98.09 
 
 
575 aa  1177    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  58.44 
 
 
556 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  59.22 
 
 
547 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
575 aa  1195    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  53.65 
 
 
570 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  48.15 
 
 
574 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  52.87 
 
 
519 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.27 
 
 
534 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.27 
 
 
534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.04 
 
 
529 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  42.77 
 
 
542 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  41.19 
 
 
545 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.24 
 
 
530 aa  369  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  40.37 
 
 
538 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.58 
 
 
530 aa  359  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.43 
 
 
575 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  34.68 
 
 
543 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  37.5 
 
 
521 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.25 
 
 
539 aa  346  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  38.88 
 
 
529 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  37.35 
 
 
536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.07 
 
 
526 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.67 
 
 
525 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  36.45 
 
 
540 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  36.28 
 
 
641 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.42 
 
 
525 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  35.28 
 
 
539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  35.21 
 
 
542 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  35.38 
 
 
524 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.59 
 
 
551 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  35.27 
 
 
550 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.78 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.33 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  32.89 
 
 
506 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.85 
 
 
506 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.12 
 
 
507 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  33.41 
 
 
506 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  34.06 
 
 
627 aa  259  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  34.71 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  35.8 
 
 
560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  32.44 
 
 
553 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  28.52 
 
 
529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.6 
 
 
560 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.19 
 
 
571 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  29.5 
 
 
519 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.49 
 
 
559 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.4 
 
 
559 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  26.15 
 
 
559 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.77 
 
 
557 aa  171  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26 
 
 
543 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 
533 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.31 
 
 
525 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  25 
 
 
540 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  25.09 
 
 
547 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.1 
 
 
518 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.88 
 
 
529 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  22.46 
 
 
546 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  22.08 
 
 
534 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.83 
 
 
525 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.24 
 
 
539 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.87 
 
 
539 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  25.59 
 
 
496 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  24.23 
 
 
527 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  23.54 
 
 
555 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  24.86 
 
 
539 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  24.02 
 
 
539 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.53 
 
 
374 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.4 
 
 
540 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.86 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.94 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  25.22 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.19 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.75 
 
 
389 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  22.14 
 
 
403 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  23.85 
 
 
503 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.55 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  21.17 
 
 
403 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  23.41 
 
 
503 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.41 
 
 
503 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.75 
 
 
389 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.28 
 
 
389 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  22.86 
 
 
377 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  24.89 
 
 
377 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  23.81 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  23.37 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.61 
 
 
389 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  22.82 
 
 
376 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.11 
 
 
503 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  24.18 
 
 
366 aa  57.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  21.45 
 
 
361 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  25.31 
 
 
389 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>