135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4991 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  87.87 
 
 
503 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  100 
 
 
503 aa  959    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
503 aa  959    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  97.42 
 
 
503 aa  910    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  75.05 
 
 
504 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  74.2 
 
 
504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  73.99 
 
 
504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  74.2 
 
 
504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0847  PepSY-associated TM helix  46.27 
 
 
505 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09370  hypothetical protein  57.46 
 
 
391 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00862923  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.79 
 
 
525 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  27.91 
 
 
506 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.58 
 
 
533 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  27.82 
 
 
506 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.2 
 
 
374 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  23.12 
 
 
497 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  26.05 
 
 
543 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  27.7 
 
 
540 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.38 
 
 
501 aa  97.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.08 
 
 
518 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.91 
 
 
539 aa  94  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  27.21 
 
 
519 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  25.47 
 
 
502 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.98 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.55 
 
 
526 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.45 
 
 
530 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  25.7 
 
 
529 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.45 
 
 
530 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  26.61 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  26.09 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  27.21 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.68 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  27.84 
 
 
538 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.18 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  24.46 
 
 
641 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  21.83 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  26.28 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  27.99 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.07 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23 
 
 
534 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.83 
 
 
506 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  26.44 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.62 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.41 
 
 
540 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.78 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  25.25 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  23.49 
 
 
559 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.12 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.81 
 
 
539 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.81 
 
 
539 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.77 
 
 
529 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  29.18 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.33 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.9 
 
 
557 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  24.5 
 
 
627 aa  70.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  21.59 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.58 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.27 
 
 
554 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  21.11 
 
 
539 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.6 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  21.78 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  23.35 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  25.21 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  20.89 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.22 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  22.83 
 
 
559 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.49 
 
 
575 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.43 
 
 
575 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  24.17 
 
 
383 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  24.17 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  21.28 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.55 
 
 
575 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  25.42 
 
 
371 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.83 
 
 
507 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.83 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.83 
 
 
370 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  24.04 
 
 
376 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  23.43 
 
 
565 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.17 
 
 
525 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3271  PepSY-associated TM helix  27.46 
 
 
373 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  25.17 
 
 
370 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.57 
 
 
541 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  20.95 
 
 
534 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.92 
 
 
571 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  22.11 
 
 
521 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  26.85 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.06 
 
 
556 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  25.26 
 
 
377 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.07 
 
 
377 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  28.43 
 
 
527 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.13 
 
 
399 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  26.64 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  20.87 
 
 
546 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.3 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.41 
 
 
529 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  23.91 
 
 
393 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  23.12 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  26.39 
 
 
397 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  23.88 
 
 
550 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>