More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1759 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1759  integrase family protein  100 
 
 		 504 aa  990    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369791  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  35.24 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2011  integrase family protein  33.47 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25.84 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  32.77 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  28.25 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.23 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  33.85 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  34.02 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  31.4 
 
 		 294 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  33.72 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  29.73 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.02 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  28.5 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.78 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.49 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31.79 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  28.84 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.57 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.46 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  34.78 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  28.22 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  23.1 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.11 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  27.75 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.45 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  31.35 
 
 		 314 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  26.7 
 
 		 298 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 294 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.65 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  30.34 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  29.27 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  28.15 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  30.99 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.28 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  33.52 
 
 		 292 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.02 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  29.41 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  34.64 
 
 		 317 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.3 
 
 		 376 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.64 
 
 		 370 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.49 
 
 		 302 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.91 
 
 		 302 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  26.26 
 
 		 324 aa  55.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.76 
 
 		 376 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 299 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  26.63 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.76 
 
 		 376 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  28.83 
 
 		 304 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 310 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.46 
 
 		 296 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.39 
 
 		 308 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  54.3  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.75 
 
 		 310 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  28.04 
 
 		 320 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  21.74 
 
 		 451 aa  53.9  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.73 
 
 		 298 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  28.82 
 
 		 333 aa  53.5  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.81 
 
 		 294 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 295 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.16 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.43 
 
 		 310 aa  53.5  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.6 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.13 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  20.78 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  29.5 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  27.72 
 
 		 319 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 317 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  28.11 
 
 		 338 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.87 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  28.5 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 319 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  26.59 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.98 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.22 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  32.83 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  21.17 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.86 
 
 		 295 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  33.95 
 
 		 363 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  28.57 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  30.05 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  30.05 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>